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 甄瑩

來自 西湖大學 的圖片

本名 甄瑩

國家 中國

外語

甄瑩,是中國西湖大學著名的研究員、博士生導師。[1]

目錄

簡介

甄瑩,2003年在北京大學獲得生命科學學士,2009年在美國堪薩斯州立大學獲得生物學博士,2010年起在美國普林斯頓大學生態與進化系從事博士後研究;2014年起在美國加州大學洛杉磯分校生態與進化系以及環境與可持續發展研究所做博士後。

於2018年底全職加入西湖大學生命科學學院 ,任研究員、博士生導師。

學術成果及研究方向

研究、保護、利用生物多樣性,是人與自然和諧共生和長治久安的基礎。演化生物學和生態學作為生物學中最早發展的領域,致力於理解生命世界多樣性的起源、歷史和發展規律,在基礎研究領域的重要性不言而喻。T. Dobzhansky曾說,Nothing in biology makes sense except in the light of evolution。近年來,基因組大數據的迅速發展和普及,給傳統的演化學和生態學帶來了前所未有的機遇。科學家已經獲得了大量模式物種的全基因組序列,對各種非模式生物基因組的研究方法也有了長足的進步,能夠快速獲得較以前多成千上萬倍的基因組信息,使演化基因組學和生態基因組學成為目前基因組學中最為活躍的交叉方向之一。

甄瑩博士以探索適應性演化的分子遺傳機制為中心,結合基因組學大數據、生物信息學分析和分子遺傳試驗,在不同的模式和非模式生物體系中研究適應性演化的分子機制。主要發現包括:1)通過全新的模型和算法發現人與黑猩猩間分化的蛋白編碼位點中至少20%是受正向選擇所影響,並進一步發現人有比小鼠和果蠅更多更強的有益新突變;2)通過解析多種食草性昆蟲對心臟干擾素的毒素耐受性的遺傳機制發現了適應性演化有一定的可預測性;3)用深度種群基因組學方法研究非洲熱帶雨林區域鳥類、昆蟲、爬行類等多個物種的基因組多樣性以及適應性演化,該結果正在被研究人員用以更好地規劃和保護該區域現有的生物多樣性。

這些基礎研究幫助我們了解豐富多彩的自然界,不僅有重要的演化學和生態學意義,而且對優化生態保護修復、新藥及殺蟲劑的開發提供理論基礎。目前課題組主要研究方向包括(但不限定於):

1. 利用趨同演化體系更深入的研究適應性演化機制及其限制因素

2. 理解不同生態環境下自然種群生物多樣性發生規律及適應性演化機制

3. 解析全新性狀演化的遺傳發育基礎及規則

代表論文

1. Ying Zhen#, Christian D. Huber, Robert W. Davies, Kirk E. Lohmueller#. Greater strength of selection and higher proportion of beneficial amino acid changing mutations in humans compared with mice and Drosophila melanogaster. Genome Research (2021). 31:110–120.

2. Ying Zhen#, Ryan J. Harrigan, Kristen Ruegg, Eric C. Anderson, Thomas C. Ng, Sirena Lao, Kirk E. Lohmueller, and Thomas B. Smith. Genomic divergence across ecological gradients in the Central African rainforest songbird (Andropadus virens). Molecular Ecology (2017). 26, 4966–4977

3. Ying Zhen, Matthew L Aardema, Edgar M Medina, Molly Schumer, Peter Andolfatto. Parallel molecular evolution in an herbivore community. Science (2012).337:1634-7.

4. Ying Zhen#, Preeti Dhakal and Mark C. Ungerer. Fitness benefits and costs of cold acclimation in Arabidopsis thaliana. American Naturalist (2011). Vol. 178, No. 1, pp. 44-52.

5. Ying Zhen, Mark C Ungerer. Relaxed selection on the CBF/DREB1 regulatory genes and reduced freezing tolerance in the southern range of Arabidopsis thaliana. Molecular Biology and Evolution (2008). 25(12):2547-55.  

6. Ying Zhen, Mark C Ungerer. Clinal variation in freezing tolerance among natural accessions of Arabidopsis thaliana. New Phytologist (2008). 177 (2), 419–427.

參考來源

  1. 甄瑩, 西湖大學, 2025-02-14