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熒光顯微鏡原圖鏈接來自 天津醫科大學腫瘤醫院 的圖片

熒光顯微鏡是一種使用熒光或磷光物質的光學顯微鏡，或除此之外使用反射和吸收用於研究的有機或無機物質的特性。「熒光顯微鏡」是指使用熒光來產生一個圖像的任何顯微鏡，無論是更簡單的設置像落射熒光顯微鏡，或更複雜的設計如共聚焦顯微鏡，其使用光學切片，以獲得更好的分辨率的熒光圖像。

2014年10月8日，諾貝爾化學獎頒給了艾力克·貝齊格（Eric Betzig），W·E·莫爾納爾（William Moerner）和斯特凡·W·赫爾 （Stefan Hell），獎勵其發展超分辨熒光顯微鏡（Super-Resolved Fluorescence Microscopy），帶領光學顯微鏡由微米µm（1米的10的負6次方，百萬分之一米）進入納米nm（1米的10的負9次方，十億分之一米）級尺度中。

原理

樣品被照射特定波長（或波段）的光，其被熒光團吸收，導致它們發出更長波長的光（例如，和被吸收的光不同的顏色）。通過使用光譜發射濾片，該照明光被從弱得多的發射熒光中分離出來。

近年來在生物學研究中，熒光標籤被廣泛地使用來標定生物分子，使熒光顯微鏡變得更加重要。它以水銀燈或氙氣燈為光源，搭配具激發濾片，發散濾片濾片組的光學儀器。

目前被普遍使用的熒光顯微鏡，是屬於落射熒光顯微鏡（Epi-Fluorescence Microscopes，見右圖），是指激發光的來源和觀察的位置（接目鏡），皆位於樣品的同方，通過相同的光路。這些顯微鏡被廣泛應用於生物學，並且是更先進的顯微鏡設計的基礎，例如共聚焦顯微鏡或全內反射螢光顯微鏡(TIRF)。

光源

熒光顯微鏡要求強烈的，近乎單色光的照明，這是一些普遍的光源，比如鹵素燈泡不能提供的。四種主要類型的光源的使用，包括氙氣燈或帶有激發濾片(Excitation Filter)的水銀燈，激光，超連續光譜光源，和高功率發光二極管(LED)。激光被最廣泛地用於更複雜的熒光顯微技術，像共聚焦顯微鏡或全內反射螢光顯微鏡(TIRF)。而氙氣燈，水銀燈，和發光二極管（LED）與分色激發濾片通常被用於廣角落射熒光顯微鏡(Epi-Fluorescence Microscopes)。

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