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垂井車站（日語：垂井駅〔垂井驛〕／たるいえき〔たるゐえき〕 Tarui eki）是一由東海旅客鐵道（JR東海）所經營的鐵路車站，位於日本岐阜縣不破郡垂井町，是東海道本線沿線的車站之一，也是所在地垂井町的主車站，設有綠窗口。
特殊路線配置
途經垂井車站的鐵軌乍看之下似乎是很一般的上下行分離複線設計，但實際上並不是。東海道本線雖然是採全線複線配置，但途經垂井車站的卻只有上行的本線，下行本線在1944年時進行路線變更，改經過位於本站北方約3公里處的新垂井車站（已於1986年時廢站），以解決二戰期間由於大垣至關原兩站之間路線縱坡度過大，下行的蒸氣機車因為牽引力不足而必須在大垣停車加掛輔機且拖行車廂數有限的困擾。然而，考量到行經垂井的普通列車之需要，在戰後的1946年時，在與上行本線平行的原下行本線路基上重新修築了一條上下行列車共用的簡易支線，命名為「垂井線」，因此今日實際通過垂井車站的是東海道本線的上行本線與支線的垂井線，下行本線反而迂迴繞過本站直接連結前後站的大垣與關原兩站。
車站結構
構內北側為側式月台1面1線，南側為島式月台1面2線，合計2面3線的地面車站的跨站式站房。
月台配置
| 月台 | 路線 | 方向 | 目的地 | 備註 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 東海道本線 | 上行 | 大垣、名古屋方向[1] | |
| 2 | 關原站始發、待避列車 | |||
| 3 | 東海道本線 （途經垂井線） |
下行 | 米原、京都方向[1] | |
| 上行 | 大垣、名古屋方向 | 只限關原站始發 |