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王秀杰
中科院遗传发育所研究员
出生 1977年7月
黑龙江省绥化市
国籍 中国
母校 南开大学、香港科技大学、洛克菲勒大学
职业 科研工作者

王秀杰,女,汉族,1977年7月生于黑龙江省绥化市博士研究生学历。1995年9月加入中国共产党。1998年获南开大学生物专业学士学位,2000年获香港科技大学生物化学专业硕士学位,2004年获得美国洛克菲勒大学生物信息学专业博士学位。2004年底加入中国科学院遗传与发育生物学研究所,入选中科院"百人计划"[1],现任中科院遗传发育所研究员、分子系统生物学研究中心主任与党支部书记[2],国家重大科学研究计划项目首席科学家。中国共产党十九大代表。

王秀杰主要从事真核生物非编码RNA相关的研究工作,并取得了一系列重要成果。包括首次对模式植物拟南芥中的microRNA和反义RNA进行系统发现与功能预测、首次发现单纯疱疹病毒编码的microRNA并研究其与宿主的关系、发现引起心衰的microRNA等,多项成果受到国际科研媒体的推荐与关注。她开发出的GOEAST等生物信息软件成为生物学家广泛使用的数据分析工具。2004年底回国工作以来,她发表SCI科研论文19篇,与相关研究组在Nature等杂志上合作发表论文35篇 。2013年获得第十七届中国青年五四奖章 。

个人经历

博士生导师,研究员。截止2013年6月,己发表SCI论文60余篇,Google scholar 统计引用达2000余次。

1994年,她以630分的优异成绩成为绥化市高考理科状元;

1998年,获南开大学生物学学士学位;

2000年,获香港科技大学生物化学硕士学位;

2004年,获美国大学洛克菲勒大学生物信息学博士学位,同年在洛克菲勒大学从事博士后研究;

2004年,加入中国科学院遗传与发育生物学研究所,从此成为中国最年轻的博士生导师。

2004年6月获洛克菲勒大学 (The Rockefeller University) 生物信息学方向博士学位, 同年在洛克菲勒大学从事博士后研究。

2005年1月加入中国科学院遗传与发育生物学研究所。

2012年获得"中央国家机关五四青年奖章标兵"荣誉称号[3]

2013年获得"中国青年五四奖章",应邀在京参加了"实现中国梦、青春勇担当"主题团日活动。在中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平等中央领导同志与各界优秀青年代表的座谈会上,王秀杰研究员结合自身科研工作和个人成长经历,做了专门发言。

研究领域

王秀杰博士领导的创新研究组的主要研究方向是生物信息学和系统生物学。我们将发挥计算机在处理大规模生物学数据上的优势, 运用现代生物信息学技术, 对公共数据库中的各种生物数据进行系统分析, 来发现新的基因和基因表达调控机制,构建遗传网络调控模型,从宏观上阐释生命调控的规律。

主要研究内容包括:

1.真核生物中非编码RNA的发现和功能研究

利用新一代的高通量测序方法和生物信息学分析方法,对真核生物不同生长时期和生长条件下表达的小分子非编码RNA进行系统地发现和功能研究。

2.转录组数据分析和新基因预测

从cDNA、EST、基因芯片及全基因组小分子RNA表达谱等转录组数据中,发现新的编码及非编码基因,挖掘基因表达规律和基因间的表达调控关系,构建基因表达调控网络模型。

3.生物信息学算法和软件的开发

4.干细胞多能性相关非编码RNA功能研究

成就荣誉

2004年,受聘于中国科学院遗传与发育生物学研究所,任课题组组长,研究员,博士生导师,成为中国最年轻的博士生导师。

王秀杰
王秀杰研究员做研究所重点领域报告

2005年,入选中科院"百人计划"项目。

2006年获得了国家自然科学基金委创新群体基金的资助。

2007年获得国家杰出青年科学基金和美国杜邦公司青年科学家奖。

2012年获得"中央国家机关五四青年奖章标兵"荣誉称号。

2013年获得"中国青年五四奖章",并在在中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平等中央领导同志与各界优秀青年代表的座谈会上,做了专门发言。

2020年11月,获得第八届中国侨界贡献奖一等奖[4]

开发软件

GOEAST (Gene Ontology Enrichment Analysis Software Toolkit)[2] 基因本体富集分析软件工具箱,2008年发在《Nucleic Acids Res》(核酸研究)杂志上 。截止2013年6月,Google scholar统计引用218次,网站软件日使用40次以上。

psRobot (Plant Small RNA Analysis Toolbox)[3] 植物小分子RNA分析工具,要分为两个功能模块,第一个功能模块提供与小分子RNA本身相关的信息,包括小分子RNA在参考基因组上的定位以及茎环结构的位置、在不同小分子RNA合成蛋白突变体或AGO结合实验中的表达水平等。用户可以基于上述分析结果来判断小分子RNA的产生与作用过程。第二个功能模块进行小分子RNA的靶基因预测,提供包括参考序列库中的所有靶基因位点列表、靶位点的多重性、靶位点的保守性以及降解组数据等生物实验数据信息。

发表文章

截止2013年6月10日,Google scholar检索显示,己发表论文(包括合作论文)共80篇,引用2841次,引用大于10次的文章39篇。具体文章列表可访问遗传发育所研究队伍成员介绍或用Google school/Web of Knowledge联合检索作者姓名及单位。

近三年部分优秀文章推荐

Wu HJ, Wang ZM, Wang M andWang XJ*. (2013) Wide-spread long non-coding RNAs (lncRNAs) as endogenous target mimics (eTMs) for microRNAs in plants.Plant Physiology161:1875-84.2.

Ling HQ, Zhao S, Liu D, Wang J, Sun H, Zhang C, Fan H, Li D, Dong L, Tao Y, Gao C, Wu H, Li Y, Cui Y, Guo X, Zheng S, Wang B, Yu K, Liang Q, Yang W, Lou X, Chen J, Feng M, Jian J, Zhang X, Luo G, Jiang Y, Liu J, Wang Z, Sha Y, Zhang B, Wu H, Tang D, Shen Q, Xue P, Zou S,Wang X, Liu X, Wang F, Yang Y, An X, Dong Z, Zhang K, Zhang X, Luo MC, Dvorak J, Tong Y, Wang J, Yang H, Li Z, Wang D, Zhang A, Wang J. (2013) Draft genome of the wheat A-genomeTriticum urartu.Nature496:87-90.

Li RC, Tao J, Guo YB, WU HD, Liu RF, Bai Y, Lv ZZ, Luo GZ, Li LL, Wang M, Yang HQ, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ, Xu M* and Wang SQ*. (2013) In vivo suppression of microRNA-24 prevents the transition toward decompensated hypertrophy in aortic-constricted mice.Circulation Research112: 601-605. Zheng G, Dahl JA, Niu Y, Fedorcsak P, Huang CM, Li CJ, Vagbo CB, Shi Y, Wang WL, Song SH, Lu Z, Bosmans RP, Dai Q, Hao YJ, Yang X, Zhao WM, Tong WM,Wang XJ, Bogdan F, Furu K, Fu Y, Jia G, Zhao X, Liu J, Krokan HE, Klungland A, Yang YG* and He C*. ALKBH5 is a mammalian RNA demethylase that impacts RNA metabolism and mouse fertility.Molecular Cell10: 18-29.

Li W, Shuai L, Wan H, Dong M, Wang M, Sang L, Feng C, Luo GZ, Li T, Li X, Wang L, Zheng QY, Sheng C, Wu HJ, Liu Z, Liu L, Wang L,Wang XJ, Zhao XY* and Zhou Q*. (2012) Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice.Nature490:407-411.

Xu M, Wu HD, Li RC, Zhang HB, Wang M, Tao J, Feng XH, Guo YB, Li SF, Lai ST, Zhou P, Li LL, Yang HQ, Luo GZ, Bai Y,Xi J, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ*, Meng X and Wang SQ*. (2012) Mir-24 regulates Junctophilin-2 expression in cardiomyocytes.Circulation Research111:837-841. (*co-corresponding author)

王秀杰
王秀杰

Wu HJ, Zhang Z, Wang J, Oh DH, Dassanayake M, Liu B, Huang Q, Sun HX, Xia R, Wu Y, Wang Y, Yang Z, Liu Y, Zhang W, Zhang H, Chu J, Yan C, Fang S, Zhang J, Wang Y, Zhang F, Wang G, Lee SY, Cheeseman JM, Yang B, Li B, Ming J, Yang L, Wang J, Chu C*, Chen S*, Bohert HJ, Zhu JK*,Wang XJ*and Xie Q*. (2012) Insights into salt tolerance from the genome ofThellungislla salsuginea.Proc. Natl. Acad. Sci. USA109: 12219-12224. (*co-corresponding author)

Wu HJ, Ma YK, Chen T, Wang M andWang XJ*. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox.Nucleic Acids Research40:W22-W28. Zhao YT, Wang M, Fu SX, Yang WC, Qi CK andWang XJ*. (2012) Small RNA profiling in twoBrassica napuscultivars identifies microRNAs with oil production and developmental correlated expressions and new small RNA classes.Plant Physiology158:813-823.

Sheng C, Zheng QY, Wu JY, Xu Z, Wang LB, Li W, Zhang HJ, Zhao XY, Liu L, Wang ZW, Guo CL, Wu HJ, Liu ZH, Wang L, He SG,Wang XJ, Chen ZG and Zhou Q. (2012) Direct reprogramming of sertoli cells into multipotent neural stem cells by defiend factors.Cell Research22:208-218.

Wang H, Zhang X, Liu J, Kiba T, Woo J, Ojo T, Hafner M, Tuschl T, Chua NH* andWang XJ*.(2011) Deep sequencing of small RNAs specifically associated with Arabidopsis AGO1 and AGO4 uncovers new AGO functions.The Plant Journal67:292-304.

Li W, Zhao XY, Wan HF, Zhang Y, Liu L, Zhuo L,Wang XJ, Wang L and Zhou Q. (2011) iPS cells generated without c-Myc have activeDlk1-Dio3region and are capable of producing full-term mice through tetraploid complementation.Cell Research21:550-553.

Tong M, Lv Z, Liu L, Zhu H, Zheng QY, Zhao XY, Li W, Wu YB, Zhang HJ, Wu HJ, Li ZK, Zeng FY, Wang L,WangXJ, Sha JH and Zhou Q. (2011) Mice generated from tetraploid complementation competent iPS cells show similar developmental features as those from ES cells but are prone to tumorigenesis.Cell Research21: 1634-1637.

新闻报道

2004-10-28 北京晨报、广州日报、搜狐新闻 27岁女博士当上中科院博导

2007-09-18 绥化新闻网 中国最年轻的博导

2011-12-07 中青在线 我的青春故事--王秀杰

2012-05-04 搜狐新闻 遗传发育所王秀杰荣获"中央国家机关青年五四奖章标兵"

2013-05-05 中国科学院 王秀杰研究员荣获"中国青年五四奖章"

参考来源