开放阅读框

开放阅读框(Open Reading Frame， ORF)在分子生物学中是从起始密码子开始，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列，结束于终止密码子连续的碱基序列。

由于密码子（codon）读写起始位点的不同，mRNA序列可能按六种ORF阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。

在真核生物中，ORF可能跨过外显子，在mRNA中进行拼接。^[1]

词语释义

开放阅读框[open reading frame，ORF] 是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。

在mRNA序列中，每三个连续碱基(即三联“ 密码子”）编码相应的氨基酸。其中有一个起始密码子AUG和三个终止密码子UAA，UAG，UGA。核糖体从起始密码子开始翻译，沿着mRNA序列合成多肽链并不断延伸，遇到终止密码子时，多肽链的延伸反应终止。由于读写位置不同，ORF在下图链上具有六种可能性。

软件介绍

现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如：ORF Finder的功能ORF Finder被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计，应用优于长片断、高质量的匹配。ORF Finder把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量，如果可能将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码蛋白质的特定测试收集器。最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报道。

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