微生物资源
微生物菌种资源是指可培养的有一定科学意义或实用价值的细菌、真菌、病毒、细胞株及其相关信息。它是国家战略性生物资源之一，是农业、林业、工业、医学、医药和兽医微生物学研究、生物技术研究及微生物产业持续发展的重要物质基础，是支撑微生物科技进步与创新的重要科技基础条件,与国民食品、健康、生存环境及国家安全密切相关。 [1]
目录
微生物资源保存状况
普通微生物 中国科学院于1951年成立菌种保藏管理委员会，将原保存在黄海化学工业研究社、大连科学研究所和兰州工业试验所的菌种集中管理，共收集、保存各类菌种1081株。1957年改组为中国科学院北京微生物研究室。1958年与应用真菌研究所合并成立中国科学院微生物研究所，当时保藏菌中1794株。1980年挂靠于中国科学院微生物研究所的中国普通微生物菌种保藏管理中心，2000年库藏菌种13703株，包括：古菌300株；细菌475种，2716株；放线菌596种，1578株；酵母菌239种，2178株；丝状真菌852种，6614株；用于专利程序的培养物617株；菌物标本40万号。
中国普通微生物菌种保藏管理中心的分支机构－病毒保藏管理中心设在中国科学院武汉病毒研究所。
微生物菌种资源收集保藏管理
近代微生物菌种收集保藏始于20世纪20年代，仅有零星菌种存放在有关的酿造实验室或医院。30年代后期，方心芳先生在黄海化学工业研究社开始将数量较多的菌种资源加以收集和保藏。1979年成立国家微生物菌种收集保藏专门机构。
原国家科委于1979年批准成立中国微生物菌种保藏管理委员会，下设7个国家级专业菌种保藏管理中心，分别负责农业、工业、林业、医学、兽医、药用及普通微生物菌种资源的收集、鉴定、保藏、供应及国际交流任务。制订了国家微生物菌种保藏管理条例。中国微生物菌种保藏管理委员会及下属7个专业菌种中心，在国际菌种保藏联合会(WFCC)注册，并于1991年在北京主持召开“国际菌种保藏联合会”第七届大会。它是中国微生物菌种资源收集保藏工作的鼎盛时期。自20世纪90年代中期开始，一些菌种中心由于缺少经费而面临解体，菌种保藏管理专业科技人员流失，菌种保藏库及实验室无力维修，国家菌种资源收集工作几乎停顿，库藏菌种的安全受到严重威协。直至1999年设立科技基础性工作专项后，一些菌种保藏中心才逐步开展有计划的收集、保藏工作。一些部门或地方，甚至学校和科研单位也建立了菌种保藏机构。2000年，7个国家级菌株保藏中心共计库藏30613株。
国家级菌种保藏管理中心承担国家微生物资源科技基础性工作任务，是社会公益性事业单位。在不断地为国家收集并长期有效保藏国家微生物菌种资源的同时，还持续不断地为社会提供遗传性稳定的菌种及信息。 [2]
农业微生物
包括用于农业生产、农产品加工、农业废弃物处理、农业环境保护及农业生物技术的微生物，2000年库藏菌种166属510种4000株。每年向社会提供菌种2000余份。国内食用菌、根瘤菌、生物肥料、生物饲料、生物农药生产企业大多从农业菌种中心引进菌种。1991年出版《中国农业菌种目录》第一版，2001年出版第二版。20世纪我国主要收集豆科植物根瘤菌和食用菌，1981年至2000年从27个省、直辖市、自治区采样分离菌种近2万株，经筛选后1000株结瘤固氮性能优良的菌种进入国家菌库保藏，收集食用菌菌种900株。
工业微生物
2000年保藏各类工业微生物菌种1842株，基本上包涵了食品与发酵行业各类生产及科研用微生物。向国内外生产企业和研究机构提供1002份生产和实验用菌。2001年出版了《中国工业微生物菌种目录》第二版。1981-1984年实施 “工业微生物菌种分类鉴定命名编目的研究”计划，对1296株收集菌种分期分批进行了鉴定、命名和编目，建立了中国工业微生物菌种资源和档案库，结束了来源不清、分类混乱、分散保藏、重复管理的局面。1984-1986年，承担《酒类、酱油霉菌和酵母菌生产性能测定的研究》，测定868株菌种，基本上摸清了重要生产性能的主要参数，并从中筛选出近百株有特性和具有一定适用价值的菌种。
医学微生物
中国医学微生物菌种保藏管理中心分支机构有中国医学科学院的病毒及真菌保藏分中心，还有25个医学实验室承担着医学菌种的保藏工作。2000年保藏38个属、200个种、4000株医学微生物菌种。主要有用于疾病预防、治疗、诊断的生物制品的生产用菌。
1983-1985年医学菌种中心与WHO协作组织了肺炎链球菌收集、鉴定和分型研究，有11个省、直辖市共29个医院参加了协作。3年中从病人的脑脊液、血液、胸水和中耳液分离了1000多株菌种。经系统鉴定确定712株为肺炎链球菌，分出了40个血清型，其中两个血清型为中国特有。目前，这套血清型菌种是我国最全的一套分型用菌种，已用于肺炎球菌多糖疫苗生产用菌种。
1975-1980年脑膜炎专业实验室在全国15个省、直辖市进行奈瑟氏菌种的收集和鉴定。5年共收集2500株，分出了12个血清型，其中H、I、K三个血清型属中国最早发现，已被国际认可和使用。
自20世纪60年代中期，开展钩端螺旋体的收集，共收集了3000多株，分出了67个血清型，其中有1个血清型属中国特有。有7个血清型的菌种作为钩端螺旋体疫苗生产用菌种。钩端螺旋体专业实验室于1986年被WHO确定为国际专业实验室。
另外，在沙门氏菌属、摩拉氏菌属等也进行了全国性收集和调查，收集到一些非常有价值的菌种，广泛用于预防、治疗和诊断用菌种。
兽医微生物 设在中国兽医药品监察所的中国兽医微生物菌种保藏管理中心，同时在中国农业科学院哈尔滨兽医研究所、兰州兽医研究所和上海家畜寄生虫病研究所设立了菌种保藏分中心，承担全国兽医生物制品生产检验及科研、教学实验用菌的供应任务。现保藏菌种50属230种3741株。主要是冷冻干燥保藏。这些菌种生产的兽药生物制口在我国猪瘟、马传贫、新城疫、牛疫、仔猪副伤寒等重大病防治中发挥了决定性作用，创造了巨大的经济和社会效益。其中的猪瘟兔化弱毒、马传贫弱毒、布氏杆菌猪2号弱毒和仔猪副伤寒弱毒株获得国家高度重视。猪瘟弱毒株和牛瘟弱毒株在控制猪瘟和消灭牛瘟中起决定性作用。1992年出版《中国兽医菌种目录》 （中英文合订本）第一版。
林业微生物 2000年保藏林业微生物菌科200属400种730株。包括林业用苏云金杆菌、林木病原菌、林木昆虫病毒、大型真菌和木腐菌等。对外供应菌种78株。
保藏的林木菌根真菌及苏云金杆菌产业化产品和苏云金杆菌的杀虫蛋白基因已应用于林木遗传育种。
药用微生物 设在中国医学科学院生物技术研究研究所的中国抗菌素菌种保藏管理中心（分支机构有四川抗菌素工业研究所及华北制药厂抗菌素研究所的菌种保藏分中心）。2000年保藏菌种36属290个种3000株。还为中国抗菌素研究和生产提供菌种。目前库藏菌种中有许多菌株有重要的经济价值，例如：康乐霉素博安霉素、博宁霉素、、戒台霉素、力达霉素、云南霉素和山东霉素等产生菌。
工作进展
近年国家设立了“科技基础性工作专项资金项目”，中国科学院实施了生物及标本基础性工作建设项目，农业微生物菌种中心、抗菌素菌种中心及普通微生物中心都得到了专项资金的支持，使我国菌种保藏工作有较大进展。2001年各菌种保藏中心共库藏菌种32987株，对外供应菌种17199份