李開龍
人物履歷
2015年獲得北京協和醫學院（清華大學醫學部）病理與病理生理學博士學位，2015年至2021年於美國德克薩斯大學西南醫學中心Jian Xu實驗室從事博士後研究，致力於生理及病理狀態下增強子的結構及功能解析。2021年6月入職北京大學基礎醫學院，開展遺傳調控、表觀遺傳調控及相關疾病的研究。近5年來研究成果以第一/共同第一作者身份發表於Cancer Discovery，Nature Communications 及Signal Transduction and Targeted Therapy等學術雜誌上，曾榮獲CPRIT Training Grant (2018, 2019), the Travel Award for Best Postdoc Poster, Cancer Biology Retreat (2019) 和the Collaborator of the Year Award, CRI（2020）等獎項。
研究方向
基因表達調控的研究具有廣泛的生物學意義。隨着基因組學的廣泛開展，基因的表達調控研究已經逐漸從單個基因點、線式的調控拓展到立體層面上多個基因、多個調控元件以至整個三維基因組的調控網絡，其調控紊亂往往與疾病的發生髮展密切相關。我們將致力於開發和運用基因編輯、功能基因組學、生物信息學等方法研究遺傳調控和表觀遺傳調控紊亂在機體發育、腫瘤及其他遺傳疾病發生髮展中的作用。主要包括：
1) 非編碼區調控序列變異在腫瘤發生髮展及轉移中的作用
2) 染色質三維結構變化在機體發育及腫瘤發生髮展中的作用機制
3) 表觀基因組編輯系統在罕見遺傳疾病精準治療中的應用研究
學術成果
(#Co-first author; *Co-corresponding author)
1) Yao Y#, Ye F#, Li K#, Xu P, Tan W, Feng Q*, Rao S#*. Genome and epigenome editing identify CCR9 and SLC6A20 as target genes at the 3p21.31 locus associated with severe COVID-19. Signal Transduct Target Ther. 2021 Feb 22;6(1):85.
2) Li K#, Zhang Y#, Liu X#, Liu Y#, Gu Z, Cao H, Dickerson KE, Chen M, Chen W, Shao Z, Ni M, Xu J*. Noncoding Variants Connect Enhancer Dysregulation with Nuclear Receptor Signaling in Hematopoietic Malignancies. Cancer Discov. 2020 May;10(5):724-745.
3) Li K#, Liu Y#, Cao H, Zhang Y, Gu Z, Liu X, Yu A, Kaphle P, Dickerson KE, Ni M, Xu J*. Interrogation of enhancer function by enhancer-targeting CRISPR epigenetic editing. Nat Commun. 2020 Jan 24;11(1):485. doi: 10.1038/s41467-020-14362-5.
4) Huang J#, Li K#, Cai W, Liu X, Zhang Y, Orkin SH, Xu J*, Yuan GC*. Dissecting super-enhancer hierarchy based on chromatin interactions. Nat Commun. 2018 Mar 5;9(1):943.
5) Liu X#, Zhang Y#, Chen Y#, Li M#, Zhou F#*, Li K, Cao H, Ni M, Liu Y, Gu Z, Dickerson KE, Xie S, Hon GC, Xuan Z, Zhang MQ, Shao Z, Xu J*. In Situ Capture of Chromatin Interactions by Biotinylated dCas9. Cell. 2017 Aug 24;170(5):1028-1043.e19.
6) Kim J, Hu Z, Cai L, Li K, Choi E, Faubert B, Bezwada D, Rodriguez-Canales J, Villalobos P, Lin YF, Ni M, Huffman KE, Girard L, Byers LA, Unsal-Kacmaz K, Peña CG, Heymach JV, Wauters E, Vansteenkiste J, Castrillon DH, Chen BPC, Wistuba I, Lambrechts D, Xu J, Minna JD, DeBerardinis RJ*. CPS1 maintains pyrimidine pools and DNA synthesis in KRAS/LKB1-mutant lung cancer cells. Nature. 2017 Jun 1;546(7656):168-172.[1]