轉錄組

轉錄組
原圖鏈接

轉錄組（transcriptome），轉錄組是一個或一群細胞中所有RNA分子的集合。指所有RNA（或僅指mRNA），具體取決於具體的實驗。包括每個RNA分子的量或濃度。

轉錄組可以視為蛋白質組（即基因組表達的整組蛋白質）的子集。mRNA的水平與它們編碼的蛋白質的表達水平並不成正比，mRNA翻譯成蛋白質分子的數量高度依賴於mRNA序列的翻譯起始特徵，翻譯起始序列的能力是募集核糖體用於蛋白質翻譯的關鍵決定因素。

目錄

定義

轉錄組是特定細胞中存在的所有轉錄本（transcript）的集合。 RNA的序列反映了轉錄的DNA序列。 因此，通過分析細胞中RNA或轉錄組的全部集合，研究人員可以確定生物體的細胞和組織中何時打開或關閉每個基因的時間和位置。

當研究沒有參考基因組信息的生物時，可以分析該生物的轉錄組。 某些轉錄組分析包括：從頭裝配，新基因發現，新單核苷酸多態性（SNP）和插入-缺失突變（Indel，Insertion–deletion mutation）的鑑定，新剪接變體和基因融合發現，融合基因的鑑定，轉錄組同工型發現，定量測定和調控轉錄本的鑑定。

轉錄組測序

轉錄組測序（RNA-Seq）的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，主要包括編碼RNA（mRNA）和非編碼RNA 。轉錄組測序技術主要是針對轉錄產物mRNA進行高通量測序，無需了解物種基因組信息，能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息，是基因功能及結構研究的基礎。目前已廣泛應用於生物學基礎研究、臨床診斷和藥物研發等多個領域。