JR藤森站位於京都市伏見區深草大龜谷大山町,是西日本旅客鐵道(JR西日本)奈良線的鐵路車站。車站編號為JR-D04。
京都的古老神社─藤森神社就位於本站附近,「藤森」這個名稱來自鎌倉時代就存在的藤森神社,車站名因此也採用「藤森」這個名稱[1]。此外,為了與京阪本線的藤森駅做區別,冠上「JR」的名稱。