併發症如中耳炎、頸部淋巴腺炎、扁桃腺炎，甚至可以引起身體重要器官如中樞神經、 [[ 心臟 ]] 、[[肝臟]]、腸胃道、血液、肌肉及關節病變。另外有一些病人也會出現全身性皮疹，或多形性紅斑；有些氣喘的病童，會因為黴漿菌感染而促使氣喘發作症狀更嚴重。<ref>[https://www.cdc.gov.tw/Category/Page/IJdbbqfuYQG9IfiWaKk3yQ 黴漿菌肺炎]衛生福利部 疾病管制署</ref>