每一部編進書目的善本書均加蓋鈐印，分別是“ [[ 五福五代堂古稀天子寶 ]] ”、“[[八徵耄念之寶]]”、“ [[ 太上皇帝之寶 ]] ”、“ [[ 乾隆御覽之寶 ]] ”等屬於乾隆帝的璽印。<ref>{{cite book|title= [https://www.npm.gov.tw/exh96/treasurebook/index2_ch.html 天祿琳琅：乾隆御覽之寶|year=2007|publisher= ]， 國立故宮博物院|isbn=9789575625290|url=http://www.npm.gov.tw/exh96/treasurebook/index4_ch.html}}</ref> 及至《後編》既成，每部書另鈐“天祿繼鑑”。此外，亦有許多書目未列，而存在此類鈐印特徵的目外書籍。<ref>{{cite book|author=劉薔|title=天祿琳琅研究|publisher=北京大學出版社|isbn=9787301211533}}</ref>