因政局混亂，不願接受清朝統治，在27、28歲時，攜家前往台灣，定居於東寧天興縣寧南坊，憑招佃墾拓，成為大戶，以「'''陳世興'''」為墾號；除開發土地從事養殖以外，其四子陳鵬南於1719年為縣學貢生，台廈道 [[ 梁文煊 ]] 曾贈匾「貢元」，後來擔任福州府連江縣學訓導，孫子陳奇典捐任山西汾州府同知，於仕途上亦十分順遂，顯示陳家之家大業大<ref>[http://cdns.com.tw/news.php?n_id=16&nc_id=166107 為台南赤嵌文化園區植入民居元素]，中華日報，2017-06-04。</ref>。

[[ 康 熙37 熙]]37 年，陳登昌逝世，享壽60歲，於隔年葬於臺灣縣大目降大山嶺內牛稠埔（今台南新化區羊林里羊仔寮），根據總督府公文類纂中，陳登昌後人土地糾紛之理由書，可知自 [[ 康 熙38 熙]]38 年（1699年）購買安葬始祖之父陳登昌墳墓，該穴地為真武踏龜之風水寶地，後來世人以穴為山名之，前經清政府奏准欽賜墓道一支，又於墓前開築池一口， 以養山龍之脈<ref>[https://udn.com/news/story/7326/4411550 百年陳情書 曝清富商墓園是真武踏龜穴]，聯合晚報，2020-03-13。</ref>。而陳登昌死後近半年才真正下葬，即是因為其子嗣聘請堪輿師尋覓營葬吉地，停棺在堂，經踏勘各山嶺後，才在真武踏歸吉穴安葬<ref>《直轄市定古蹟陳世興宅調查研究與修復再利用計畫》，古都文教基金會，頁2-32。</ref>。