移植後心臟排斥是不定時的，當身體接受了新的心臟時身體免疫系統的T細胞會把移植的心臟當成異物而攻擊，這是人體 [[ 免疫 力|免疫]] 系統的排斥現象，也是自然的生理機轉。因服用排斥藥物，可抑制身體免疫系統產生排斥的作用，同時也抑制對抗感染的能力，因此感染是移植後主要死因之一，早期的診斷及防治並加以抗生素使用，仍可得到良好的控制及治療。