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从1975年起，魏宝文转向加速器物理，参与中国第一台大型重离子加速器的研制工作。作为这一大科学工程的总工程师，负责设计出兰州重离子加速器，并成功地主持了该项目的研制，为拓展中国的重离子物理研究作出了突出贡献。