汉斯·菲舍尔1935年与维尔特鲁德·豪费结婚。1945年，[[第二次世界大战]]结束前不久，由于自己的实验室和研究成果在轰炸中几乎全部被毁，菲舍尔过度沮丧，在慕尼黑自杀去世。