进入21世纪初，由于城市范围扩大，遗址上方的塔山路亟待扩建。经过国家文物局批准，浙江省文物考古研究所于2007年10月至2008年1月对塔山遗址进行第三期发掘。此次发掘地点位于20世纪90年代发掘区西南80米，面积1000平方米，发掘遗迹包括建筑、墓葬、灰坑、水井等，出土文物除新石器时代陶器、玉器外，还出土商周青铜箭镞、原始瓷等器物残