截至2017年9月，学院设有[[水利工程]]系、[[电力工程]]系、[[建筑工程]]系、机电工程系、信息工程系等5个专业教学系和公共基础部、马克思主义学院<ref>[ https://www.dxsbb.com/news/14489.html 福建水利电力职业技术学院最好的专业是什么（10大热门专业排名）]，大学生必备网，2020-3-16</ref>。