负责总统遇刺案调查工作的沃伦委员会在经过了长达10个月的调查之后，于1964年9月发表了一份官方报告——《沃伦报告》 <ref>[https://www.sohu.com/a/200849473_146035 今天，全美都在等这个史上最大机密揭晓，结果...... ]，搜狐，2017-10-28 </ref> 。此报告指出，刺杀肯尼迪的凶手是得克萨斯州教科书仓库大楼的雇员李·哈维·奥斯瓦尔德，他从该大楼的六楼窗口向乘坐敞篷车从楼下经过的总统开了三枪，第一枪落空（后人判断可能打到号志灯壳而偏离，再打中[[人行道]]造成碎石击伤路人詹姆士·塔格，这也是唯一没找到物证的[[子弹]]），第二枪击中肯尼迪后颈下方再穿出打到他前方的得州州长约翰·康纳利（即造成两人共七个伤口的“魔术子弹”），致命的第三枪则从后脑击穿肯尼迪的头，肯尼迪迅速被送往附近的帕克兰医院，但被宣布抢救无效。

一个后来成立的官方调查委员会——众议院遇刺案特别委员会（HSCA）从1976年到1979年再次对总统遇刺案进行了详细的调查取证，并得出结论认为，奥斯瓦尔德尽管射击了造成肯尼迪和康纳利死伤的子弹，却很有可能还有一名枪手。迄今为止，肯尼迪遇刺案仍然存在着很多疑点 <ref>[https://www.sohu.com/a/396153887_617770 肯尼迪遇刺现场的神秘老太，做一诡异举动后消失，FBI至今没查到 ]，搜狐，2020-05-19 </ref> ，引起了人们的广泛猜测，并且产生了许多关于肯尼迪遇刺案的阴谋论。