普萨美提克三世的统治[[时间]]不到六个月。这位年轻而没有经验的法老可能尽了全力来抵挡敌人的入侵，但是埃及无法对付波斯帝国 <ref>[http://www.todayonhistory.com/lishi/201603/33856.html 波斯帝国历史 波斯帝国为什么没有侵略中国？ ]，历史上的今天，2016-3-29 </ref> 。冈比西斯二世指挥的[[军队]]在阿拉伯人的帮助下穿过[[西奈半岛]]和[[沙漠]]。双方于前525年春在埃及的东方前线城市贝鲁西亚决战。普萨美提克三世被他的一个同盟者出卖后被战败。普萨美提克三世逃到[[孟斐斯]]。波斯在经过长期围攻后占据了孟斐斯，俘虏了普萨美提克三世。随后冈比西斯二世下令处死两千市内的显贵，包括普萨美提克三世的一个儿子。

希罗多德在他《[[历史]]》 <ref>[http://www.beduu.com/read-12631.html 希罗多德《历史》(上) ]，必读网</ref> 的第三卷中说，普萨美提克三世的女儿沦为[[奴隶]]、儿子被处死、朋友贬为[[乞丐]]。三人全被带到他眼前来测试他的反应，他只有在看到乞丐的时候露出愤怒的表情。普萨美提克三世本人则被囚禁到苏萨，起初他的待遇比较好，但由于他试图策谋反抗冈比西斯，最终被迫饮下污浊的牛血而死。