伞房状聚伞花序，花序轴及分枝被灰白色或棕黄色柔毛，花蕾近圆球形；萼片及花瓣均5片；萼片卵形，长不及1毫米；花瓣长约3毫米；雄花的退化雌蕊圆锥状，顶部5-4裂，裂片约与不育子房等长，被毛；雌花的退化雄蕊约为子房长的1/4，鳞片状。  [[File:臭檀吴萸3.jpg|缩略图|left|250px|[http://img1.iplant.cn/gotoimg/236/E5A3739EC9C18F31.jpg 原图链接] [http://www.iplant.cn/info/%E8%87%AD%E6%AA%80%E5%90%B4%E8%90%B8?t=p 来自植物智]]]  分果瓣紫红色，干后变淡黄或淡棕色，长5-6毫米，背部无毛，两侧面被疏短毛，顶端有长1-2.5（3）毫米的芒尖，内、外果皮均较薄，内果皮干后软骨质，蜡黄色，每分果瓣有2种子；种子卵形，一端稍尖，长3-4毫米，宽约3毫米，褐黑色，有光泽，种脐线状纵贯种子的腹面。