通过[[堆积物]]可将樊城堆遗址分七层，第一、二层为[[商周文化]]遗存，距今约3500年左右；第三层为[[龙山文化]]遗存，距今约4000年左右；第四至第七层[[为新石器时代]]晚期文化遗存，距今约5000～4500年，其下文化层与赣江东岸的[[筑卫城遗址]]下文化层属同一类型。