壁画分布在殿内墙壁上，共有9铺，佛龛背壁的3铺，画的是水月观音，文殊、普贤菩萨。水月观音面目端庄慈祥，身披轻纱，花纹精细，似飘若动。东西墙上，画的是传说故事中的天帝、帝后、天王、信女、力士和童子等，共有35个人物，高的近2米，低的只有50厘米，并有祥云、花卉、动物等衬托<ref>[https://www.sogou.com/link?url=hedJjaC291NGdX4SKwGinCG8wyHdAT-xOnBuE6sRGiLfk2hsURDe6FoNaK7TK6oneQwmx_riCnHsA0QrVk8Klv9Dm1lsycAR 法海寺的无以伦比的壁画之旅] </ref> 。法海寺的壁画素以明代院体画的典范作品而著称于世。大雄宝殿内的六面墙上，至今完整保留有10幅完整的明代壁画，分布在大雄宝殿北门西侧、殿中佛龛背后和殿中十八罗汉身后的墙上。 佛龛背后中绘观音，右绘文殊、左绘普贤二菩萨，周围绘有善财童子、韦陀、供养佛、马川狮、驯象人及鹦鹉鸟、清泉、绿竹和牡丹等。其中以水月观音画得最为传神，给人以清新明静之感。十幅[[壁画]]共绘有77个人物，姿态各异、栩栩如生。虽是550余年前的作品，至今仍保持着鲜艳的色彩，堪称佛教艺术的瑰宝。可以与敦煌宋元壁画媲 美的法海寺壁画将会被很好地封存起来，游人再来时看到的将是这些壁画的珂罗版印刷复制品。由于空气、灰尘的日久侵蚀，保存了560年的壁画出现了剥落、颜色褪色等情况。为了保护这些艺术瑰宝，市文物局决定对壁画进行复制，而原壁画将被封存。在原来药师殿的基础上将重建一座与原来一般规模的药师殿，复制的壁画将全部在这里存放，而存有明代壁画的大雄宝殿将只对文物专家开放。 [3] 据介绍，“文革”时，红卫兵住在殿内，由于过去殿内僧人点的蜡烛熏黑了大殿的下半部，而上半部比较高，殿内没有灯光，红卫兵才没发现这些壁画是由许多金箔制成的，从而逃过一劫。