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中国农业科学院棉花研究所是国家级棉花专业科研机构和全国棉花科研中心。
中国农业科学院棉花研究所 <ref>[https://m.sohu.com/a/291633585_120069846 中国农业科学院40多个研究所，哪个研究所综合实力最强？]，搜狐，2019-01-26</ref> 于1957年8月在北京成立；1958年3月迁到河南安阳；2000年3月31日增挂河南省棉花科学研究所牌匾。
据2018年8月研究所官网显示，研究所建有国家重点实验室1个，省部级重点实验室2个；有在职职工430人，硕士生导师45人、博士生导师9人；拥有博士后流动站1个。 [1-2]
==历史沿革==
2012年8月，中棉所在国际上率先完成二倍体棉花—雷蒙德氏棉全基因组遗传图谱（草图）的绘制。
2014年4月，亚洲棉 <ref>[https://www.sohu.com/a/230836184_761120 亚洲棉科研成果Nature Genetics在线发表] ，搜狐，2018-05-08 </ref> 全基因组测序组装全部完成。
2018年7月7日，中国农业科学院棉花所与郑州大学合作共建农学院。