2006年11月，经中编办批准，在质标所的基础上加挂“农业部农产品[[质量标准]] <ref>[https://www.sohu.com/a/201098059_99984871 中国农产品质量等级划分标准] ，搜狐，2017-10-30 </ref> 研究中心”的牌子，实行一个机构，两块牌子。

截至2015年7月，质标所有在职职工78人，其中研究员14人，副研究员24人；具有博士学位 <ref>[https://www.sohu.com/a/415056980_529015 最新高校硕士学位授权点动态汇总！考研必看！] ，搜狐，2020-08-26 </ref> 的29人，硕士学位的31人。其中，农业部第九届科技委员1人，国家农产品质量安全风险评估专家委员会委员5人，农业部农产品质量安全专家组[[专家]]6人，农业部农业科研杰出人才1人，中国农业科学院科技创新工程首席[[科学家]]4人。