2013年12月12日，《[[山东省人民政府]] 府 关于同意调整日照市东港区部分行政区划的批复》（鲁政函民字[2013]53号）同意：一、设立卧龙山街道办事处。将秦楼街道办事处所辖的松竹村、窝落子、山口、厉家村、庙山后、双庙、秦家官庄、竹溪村、吴家台、任家台、卧龙村、肥家庄、刘西楼、刘东楼、苏家村、杨庄子、小陈家村、大陈家村、路家村、李家台村、庙山前、后官庄、陶家村、富荣村、桃花岛村、大泉沟村、张家台村、后滩西、前滩西、王家皂、乔家墩子、东王家村、东小洼等33个行政村及青岛路、碧海路2个社区和河山镇所辖的大沙沟、卸甲庄、窝落子、西黄家庄、若家村、九山子、城壕、前沙沟、竹园、东山、东黄家庄等11个行政村划归卧龙山街道办事处管辖。办事处机关驻后滩西村。二、撤销两城镇，以其原行政区域设立两城街道办事处，街道办事处机关驻原镇政府驻地。

全区现辖7个[[ 街道]] 、7个镇：日照街道、石臼街道、奎山街道、秦楼街道、北京路街道、卧龙山街道、两城街道、河山镇、涛雒镇、西湖镇、陈疃镇、南湖镇、三庄镇、后村镇。其中，奎山街道、北京路街道由日照经济开发区代管，卧龙山街道、两城街道由山海天[[旅游]]度假区代管。区政府驻日照街道。