学院现有能源与环境工程研究所（校办所）、机械工程及自动化系、现代装备与控制工程系、热能与动力工程系、机械设计教研室、工程力学 <ref>[https://www.sohu.com/a/315826697_712926 专业介绍 | 工程力学 ]，搜狐，2019-05-22 </ref> 教研室、制图教研室和学院中心实验室等八个教学科研单位。

产学合作和科研工作。学院与美国VX公司和日本新日奔工机（南京）有限公司合作，建成“VX软件应用开发教育培训基地”；与北航海尔软件有限公司合作，建成“CAXA教育培训认证中心”（劳动和社会保障部授权的数控工艺员证书颁发单位）；现代装备及其控制技术联合实验中心是由上海工程技术大学与德国博世力士乐集团共同出资分期建设的中外联合实验基地；目前已建成的FMS柔性制造系统运用了融机械、电气、电子及[[计算机]]等技术于一体的综合技术，把不同领域和层次的知识与能力组合在一起，以机械工程自动化和机电一体化为基础，以现代工业装备控制为特色，以信息为媒介，以集成为手段，代表了现代制造业的发展方向和潮流；在这样一个大平台上，可完成机电一体化技术 <ref>[https://www.sohu.com/a/364377700_120376146 机电技术应用专业就业前景以及专业介绍 ]，搜狐，2020-01-02</ref> 、数控技术、现代装备控制、工业网络通讯、FM(柔性制造技术)、CE(并行工程)和VM(虚拟制造)等一系列教学科研活动，对教学科研能力提升、高素质本科人才和拔尖创新人才培养具有极其重要的意义。