1987年至1993年参加王绍曾先生主编的全国高校古籍整理规划项目 [[ 《清史稿艺文志拾遗》 ]] 编纂工作，任副主编。1993年至1997年参加季羡林先生主编的国务院古籍整理规划项目[[《四库全书存目丛书》]]编纂工作，任常务编委兼总编室主任。1992年至2005年独立从事全国高校古籍整理科研规划重点项目[[《四库存目标注》]]，该书2007年由上海古籍出版社出版，共8册约370余万字。所撰[[《文献学概要》]]一书，2001年由中华书局出版，2006年该书入选"十一五国家级教材"。2004年开始主持国家清史纂修工程重大项目《清

纂修项目《清史·艺文志》。2012年开始主持山东大学儒学高等研究院重大项目[[《十三经注疏汇校》]]。自1987年以来，著作 [[ 《四库存目标注》 ]] 、

《文献学概要》、 [[ 《清人著述总目》]](主编)、[[《清史艺文志》(主编)、 [[ 《微湖山堂丛稿》 ]] 、《清史稿艺文志拾遗》]](副主编)、《四库全书存目丛书》(常务编委)、《山东文献集成》(编纂处副主任)、《渔洋读书记》(王绍曾、杜泽逊编)、《清经解三编》(刘晓东、杜泽逊编)、《中国历代书目提拔丛书(第三辑)》(主编)、[[《经籍访古志》、[[《古文旧书考》]]、[[《静嘉堂秘籍志》]]、《史记校勘记》]](王绍曾、杜泽逊整理)、[[《山东著名藏书家》]](杜泽逊、程远芬撰)等。发表学术论文180余篇。