博物馆总占地25300㎡，是全国首家融“天然”和“文化”于一体，体现岭南特色的中医药建康文化自然山水园林式中医药博物馆，采用园林式设计和“堂中有园，园中有宫，宫中有馆”的整体布局，将中医药[[历史]]文化陈列展示与原生态中草药种植有机结合起来，展示了中华中医药文化、岭南中医药文化、中医养生文化、大南药文化、凉茶文化等丰富的中医药文化内涵。园区分为两大部分，一期——中华医药园于2006年11月正式对外[[开放]]，占地3000多平方米，综合运用浮雕、景墙、实物标本、仿真药具、生态种植以及[[多媒体]] <ref>[https://www.sohu.com/a/444539059_120654766 多媒体技术的基本概念和特点]，搜狐，2021-01-14 </ref> 等多种表现手法，通过划分不同的区域进行展示，将知识性、趣味性、观赏性完美结合，二期——岭南医药园于2011年11月对外开放，总用地面积约为22000㎡，展示的内容主要包括岭南医药、中医药养生、药食同源文化及药用植物种植等四个方面，特设岭南宫和松乔宫，以及百丈青龙画廊、逍遥馆、蹴鞠互动场、名方廊等特色景点。

神农草堂充分利用园区周围100余米的石坝，打造长99米，高3.3米的医史[[浮雕]] <ref>[https://www.sohu.com/a/413383814_120261803 浮雕的起源与发展]，搜狐，2020-08-16</ref> 墙，以人物故事为线索，以时间为序，讲述了从远古时期至清朝，有关中医药7000多年发展轨迹的30多个人物故事，涵盖医道群贤、经典理论、学派着述等内容。