在學術上，呂留良推崇朱子與四書，認為「舍四子書之外，亦無可講之學」，「救正之道，，必從朱子，求朱子之學，必於《近思錄》始」同時還將陽明心學的流毒當做是造成明亡的重要原因後來，湖南人曾靜在閱讀呂留良的著作之後大受激勵，在雍正六年（1728年）派遣弟子張熙遊說川陝總督岳鍾琪反清，被告發下獄，釀成了轟動一時的呂留良案。雍正帝親作《大義覺迷錄》一書，與呂留良等人的「悖逆之言」頒行全國。並在雍正十年（1733年）十二月十二日，下詔，呂留良和其子呂葆中剖棺戮屍，子呂毅中斬立決，孫輩流放寧古塔為奴。著作則被焚燬。而曾靜、張熙則被雍正留名，用以在全國宣傳《大義覺迷錄》的有關思想，但在雍正帝死後85天即被剛剛登基的乾隆帝凌遲處死。

在清朝末年，呂留良的著作對辛亥革命起到了推動的作用。如章太炎即曾表示，他十六七歲讀到呂留良、曾靜一案時「悵然不怡」，滋生「春秋賤夷狄之旨」，後來擔任東三省籌邊使時還專程到齊齊哈爾祭奠呂留良。辛亥革命勝利後，浙江都督湯壽潛將杭州西湖的彭公祠改為三賢祠，專祀呂留良及張煌言、黃宗羲。

==生平亮點==

著有《東莊詩存》、《晚村先生文集》等等。