===第4次===

民國81年(公元1992年)再次修復。

民國104年(公元2015年)，文澳城隍廟104年公告為縣定古蹟，因此第5次整修，106年完成古蹟修復。<ref>[http://www.taiwanhot.net/?p=715149 澎湖文澳城隍廟修復落成三週年　賴峰偉為歷史沿革碑揭牌]，台灣好新聞，2019-06-04</ref>

1月的時候曾辦理出火儀式，即請城隍爺移駕出廟，整修完畢之後再移駕回廟。經當地各角頭商議後，決定由石泉(第5保)恭請城隍爺回石泉朱王廟暫駐，整修完成後，由6保村民迎奉回文澳，屆時並會辦理入火儀式，請城隍爺回到廟中安座。<ref>[http://www.penghutimes.com/modules/phnews/index.php?nsn=10845文澳城隍廟源遠流長 6保鄉佬細說從頭]，澎湖時報，2016-05-04</ref>