这一年，莱佛士和大他十岁的寡妇结婚，他的行为举止，引起许多[[英国]]人的猜疑。原因是他的太太并不是真正的英国人，年纪又大，和莱佛士不相配，但这并不影响他们夫妇的感情，反而促使他们两个发奋图强，努力挤入英国上流社会的圈子。英国占领了原本属于荷兰的苏门答腊岛之后，他很快被提升成为苏门答腊的总督。在莱佛士统治的期间，他尝试实行一定程度的自治，废除奴隶贸易，修复当地的一些古迹，并以新的土地租赁系统，取代过去荷兰人统治时期的强制农业计划。他还撰写了一部《[[爪哇史]]》，借此来回顾该岛的历史。

当时[[英国]]正积极扩张其在东南亚的殖民帝版图，而[[马六甲]]也由[[荷兰]]转交英国来管辖，莱佛士对殖民帝国抱有野心，为了熟悉各个殖民地的人文风情，他努力学习马来语。莱佛士也勤于和马来人接触，探知马来人的社会风貌，渐渐成为一个海峡通，并深得当地马来人的尊敬。后来莱佛士建议把[[马六甲]]吸纳为英国的军事基地，为了此事，他常年奔波劳累，因此健康出现了问题，常年在马六甲养病。