通过东户塚站后，线路沿着较缓的“S”形曲线进入工厂群，之后横须贺线下行线在户塚站北侧上跨东海道本线旅客线转至海侧，形成方向别复复线。之后到达与横滨市营地下铁蓝线换乘的[[户塚站]]。该站在旧货物线上设置横须贺线、东海道线上行站台，旧横须贺线、东海道线上下行站台则成为下行站台，使得横须贺线列车和东海道线列车能够[[同站台换乘]]<ref name="RP872 44">{{Cite journal |author=祖田圭介 |date=2013-02-01 |title=東海道沿線の駅構内の今昔 |journal=鉄道ピクトリアル 【特集】東海道本線（Ⅰ） |pages=42 - 44 |volume=2013年2月号 |publisher=電気研究会}}</ref> 。离开户塚站后沿柏尾川南下，上行线在大船站北侧上跨东海道线，与东侧的根岸线并行进入[[大船站]]，再次形成线路别复复线。大船站旧货物线上设置东海道线上行站台，旧东海道线上行站台成为东海道线下行站台。此外，过去的东海道线下行列车可在横须贺线上行站台（副本线）或下行站台（本线）发车，在东海道线下行线移设后，下行列车只能从横须贺线站台发车。目前横须贺线站台与东海道线藤泽方向的线路相连<ref>{{Cite journal |author=祖田圭介 |date=2018-03-01 |title=線路配線の記録からみた横須賀・総武快速線 |journal=鉄道ピクトリアル 【特集】横須賀・総武快速線 |volume=2018年3月号 |page=28 |publisher=電気車研究会}}</ref>。根岸线延伸至大船站前，大船站的旅客线站台设3面6线，目前包含根岸线在内，为5面10线。大船站跨越横滨市和[[镰仓市]]边界，除了有东海道本线和根岸线接入外，[[江之岛线 (湘南单轨电车)|湘南单轨电车江之岛线]]列车也在此站到发。

大船站以南为横须贺线主线区间。线路在离开大船站后，与根岸线的联络线汇合，并与通往{{link-ja|镰仓车辆中心|鎌倉車両センター}}的引入线相连。线路之后转向东南，下穿湘南单轨电车，并与通往镰仓综合车辆中心（{{link-ja|东日本旅客铁道大船工厂|東日本旅客鉄道大船工場|大船工厂}}）的出入厂线相连，这一中心是2006年废止的JR东日本车辆工厂。在1973年4月9日根岸线[[洋光台站]]－大船站区间开通前，大船站的线路按方向布置，在藤泽侧的车辆中心引入线连接点附近，横须贺线上行线以立交桥跨越东海道本线下行线，这一立交桥至今仍在使用。此外在旧大船工厂出入厂线连接到东海道货物线的联络线与东海道本线上行线存在平面交叉，成为运输瓶颈，再加上夹角为钝角，列车通过时受到的冲击大。在根岸线延伸至大船站后，根岸线和东海道货物线的联络线在大船站东京侧设置立交桥跨越其他线路，上述的平面交叉废止，而从东海道货物线去往横须贺线的货物列车，则须先经这一立交桥到达根岸线[[本乡台站]]，再折返经大船站进入横须贺线<ref name="RP872 44" /> 。

|rowspan="2"|[[File:JR area KU.svg|13px|[区]]][[File:JR area YAMA.svg|13px|[山]]] [[品川站|品川]]