島上有數個火山，包括仁田尾山（526公尺）、三角點山（600公尺）、古岳（657公尺）、新岳（626公尺），其中新岳現在仍有火山活動，在山頂有直徑200公尺的火山口，並其被[[日本氣象廳]]納入「[[火山噴發預警級別]]」系統。<ref>[https://www.town.yakushima.kagoshima.jp/info-living/16466/ 口永良部島の噴火警戒区域の変更について]，yakushima</ref>  

2014年8月，新岳再次發生火山爆發，噴煙高度達800[[公尺|米]]，日本氣象廳將火山噴發預警級別提昇至第3級（入山管制） 。2015 。<ref>[https://www.jstage.jst.go.jp/article/bullgsj/66/5-6/66_103/_article/-char/ja/ GPS 連続観測による口永良部島火山の2014 年噴火10 年前からの地盤変動]，jstage</ref>  2015 年5月29日，新岳再次發生大規模火山爆發，噴發高度達9000米，並導致1名居民受傷，日本氣象廳再將火山噴發預警級別直接提昇至最高的第5級（避難），因此島上近140位居民及遊立刻被強制撤離至[[屋久島]]，這亦是自2007年日本設立預警級別制度以來首次發出第5級警報。此第五級警報一直到2016年6月才解除降至等級三（入山管制）<ref>{{Cite web| url=http://www.data.jma.go.jp/svd/vois/data/tokyo/STOCK/volinfo/VJ20160614180019_509.html| script-title=ja:噴火警報（火口周辺）(口永良部島)平成２８年６月１４日１８時００分| publisher=氣象廳| date=2016-06-14| accessdate=2016-10-19| language=ja| archive-date=2016-10-19| archive-url=https://web.archive.org/web/20161019151534/http://www.data.jma.go.jp/svd/vois/data/tokyo/STOCK/volinfo/VJ20160614180019_509.html| dead-url=no}}</ref> ，並允許居民回到島上<ref>{{Cite web| url=http://www.town.yakushima.kagoshima.jp/info-prevention/8759/| title=關於解除口永良部島避難指示及劃定警戒區域| publisher=屋久島町町役所| date=2016-06-27| accessdate=2016-10-19| language=ja| archive-date=2018-09-29| archive-url=https://web.archive.org/web/20180929132030/http://www.town.yakushima.kagoshima.jp/info-prevention/8759/| dead-url=no}}</ref> 。

2018年8月15日，由於觀測到新岳發生多次火山性地震，火山噴發預警級別再度提昇至第4級（準備避難）<ref>{{Cite news| url=https://www3.nhk.or.jp/lnews/kagoshima/20180816/5050003857.html| script-title=ja:口永良部島 活発な火山活動続く| date=2018-08-16| accessdate=2018-08-16| work=NHK| language=ja| archive-url=https://web.archive.org/web/20180816130034/https://www3.nhk.or.jp/lnews/kagoshima/20180816/5050003857.html| archive-date=2018-08-16| dead-url=yes}}</ref> ，不過之後並未發生火山爆發，僅兩週後預警級別又降回。第3級（入山管制）直到2019年1月17日，新岳突然發火山爆發，但至目前為止此次爆發並未造成任何損害。<ref>[https://www.chinatimes.com/realtimenews/20190117001396-260408?chdtv 日本鹿兒島縣口永良部島發生火山爆發]，chinatimes，2019/01/17</ref>

原本島上每天有一班町營渡輪「太陽渡輪」來回[[屋久島]]的宮之浦碼頭。但在2015年因島上火山爆發，島上渡輪曾經停止營運達半年<ref>{{Cite web| url=http://www.town.yakushima.kagoshima.jp/info-prevention/4707/| title=關於口永良部島的爆發| publisher=屋久島町町役所| date=2015-05-29| language=ja| access-date=2015-05-30| archive-url=https://web.archive.org/web/20150529093638/http://www.town.yakushima.kagoshima.jp/info-prevention/4707/| archive-date=2015-05-29| dead-url=yes}}</ref> ，現已於2015年底恢復營運。