西域一带在可考历史中于前5世纪左右形成国家，并开始独立发展。《汉书·西域传》记载当时已有30余国分布在西域地区，故有“西域三十六国”之说。在张骞打通西域之前，匈奴一直是支配西域各国的势力。至汉代，行政机构西域都护府所管辖范围则已不只36国，《汉书·西域传》亦记载在前6年~5年中西域分裂为50余国。东汉末年，西域各国相互之间不断兼并，至晋朝初年形成了鄯善、车师等几个大国并起的局面。南北朝时期，西域局势再度变化，新兴的高昌国相继击败西域诸个国家，建立了一个地跨新疆大部的强国，除少数国家外西域诸国国土西迁，为中亚地区带来了繁荣的文化。<ref>[2https://wenku.baidu.com/view/d8151aeafe4733687e21aab5.html 西域——不可不知道的历史名词]，百度文库 2015-12-02</ref>

汉宣帝神爵二年(前60)在此设西域都护府， 名为乌垒城（前名轮台国）是当时汉朝管理西域三十六国的政治、经济、文化和军事中心，当时西域都护由皇帝亲自任命，3年1替（也有延长和缩短的）从未间断，据《汉书》记载：西汉历任都护18人，其中立传可考的历史上著名的有郑吉、郑宣、甘延寿、段会宗、廉褒、韩立、郭舜、孙健、李崇、但钦等10人。当时轮台国是个城郭之国。都护府直接对其统辖，轮台王曾多次受皇帝亲召幸朝。汉朝另设置戍已校尉、戍部候等行政、军事、机构，对当地的少数民族上层人物封以王、侯、将、相、大夫、都尉等官职，他们均受西域都护府的管辖。<ref>[http://bq.kongfz.com/description_35224/ 西域 简介]，孔夫子旧书网</ref>

在此有两处古城遗址：一处是乡政府东面一公里的一座小方城池，被水流冲刷过，城垣仅存1米，夯土干打垒建筑，建筑材料为黄沙土、防潮层，拉筋建筑材料为胡杨树枝，每0.33米为一叠层，周长约百米，城内散布着青灰色陶片，有白色的刻画点云纹和水波纹，城东有一城楼，南有城门。另一处古城遗址在乡政府东面10公里公路北侧，当地人称白土墩，估计是烽燧，1928年，我国著名的史地专家黄文弼先生在上述两处遗址上发掘出一些存贮粮食的陶罐，认为是西域都护府设立时期士卒在这里屯守的用物。黄文弼先生还在野云沟乡东北300米处发现了另一处较大的遗址，可惜现已辟为农田，他在所著的《塔里木盆地考古记》中写道：“野云沟村南约半里，有一高阜，面为深沙堆集，上生芦苇，间有红陶片” <ref>[http://m.sohu.com/a/128879618_651763 帝国刀锋之西汉名将郑吉（下）：首任西域最高军政长官]，搜狐网 2017-03-15</ref> 。

西汉宣帝第二年（公元前68年）派侍郎郑吉屯田渠黎（今新疆尉黎一带），与匈奴争夺东师，使护卫鄯善以西“南道”诸国安全。至神爵二年（前60年），匈奴逐日归降汉朝，郑吉派兵迎之，宣帝又命郑吉监护车师西北方（北道）各国的安全，因总领两道，遂号都护，此后“都护”就成为西汉派驻西域的最高长官的正式官名。西域都护官秩二千石，相当内地郡守，其下设副校尉、丞、司马等属吏。西域都护的设置，保证了丝绸之路的畅通，加强了民族间的团结和经济文化交流，标志西域正式归属中央政权。同时，因其在当地实行屯田政策，也在一定程度上促进了西域农业生产的发展。王莽时期撤除，东汉或设或撤，安帝永初元年（107年）撤除。<ref>[4http://www.docin.com/p-15162224.html 西域都护]，豆丁网</ref>

20世纪80年代中期，英国学者埃德尔（M.Erdal）和格隆克（M.Gronke）刊布了新疆莎车发现的一批黑汗王朝文书，包括7件阿拉伯文契约，5件阿拉伯文突厥语文书，7件回鹘文突厥语文书，年代在公元11－12世纪。13－15世纪称雄中亚的察合台汗国，也用阿拉伯文拼写突厥语，通称察合台文。如今这种文字成了现代维吾尔文的标准字体，并与汉语拼音、回鹘式蒙文、藏文、壮语拼音一起，印刷在人民币上。<ref> [5https://www.docin.com/p-516721865.html 西域文明的变迁]，豆丁网</ref>