[[ 雍正 ]] 年间：副本收藏在翰林院。

乾隆三十九年(1774年)，四库全书纂修官 [[ 黄寿龄 ]] 私自将《永乐大典》六册，带回家中，途中失窃。乾隆帝指责说：" “ 《永乐大典》，为世间未有之书！本不应该听纂修等携带外出！" ” 下令严查，全城戒严。不久六册书在御河桥边被发现，失而复得。

[[ 嘉庆 ]] 十三年(1808年)纂修《全唐文》，大臣奉旨入阁参考《永乐大典》。

[[ 道光 ]] 年间纂修《大清一统志》，多参考《永乐大典》。

[[ 光绪 ]] 元年(1875年)：不足五千册。

光绪二十年(1894年)： [[ 翁同和 ]] 入翰林院查点，仅存八百余册。

光绪二十六年(1900年)：义和团围攻 [[ 东交民巷 ]] 外国使馆，6月23日，位于 [[ 英国使馆 ]] 北邻的翰林院遭纵火，《永乐大典》几乎全部遭到焚毁，所余无几。翰林院内仅存六十四册被陆润庠运回府中。(有说永乐大典为 [[ 八国联军 ]] 烧毁，但此时八国联军刚刚登陆大沽，尚未进入北京)

1912年， [[ 中华民国政府 ]] 成立，国务院批准将翰林院所存《大典》残本送归教育部，60册置于京师图书馆，4册置于教育部图书室展览。

1920年， [[ 叶恭绰 ]] 赴 [[ 欧洲 ]] 考察实业，在 [[ 伦敦 ]] 一间小古董铺里意外发现并购回《大典》卷一三九九一残本。

1951年： [[ 苏联 ]][[ 列宁格勒大学 ]] 将11册《永乐大典》归还中国。 [[ 上海商务印书馆 ]] 董事会将原藏商务印书馆所属东方图书馆的二十一册捐献出来。 [[ 顾子刚 ]] 捐赠三册，系北洋军阀 [[ 徐世昌 ]] 所有， [[ 周叔弢 ]] 、 [[ 赵元方 ]] 、 [[ 张季芗 ]] 、 [[ 郑广权 ]] 、 [[ 王富晋 ]] 、 [[ 陈李蔼如 ]] 、 [[ 赵玉林 ]] 等先后各捐一册。

1954年： [[ 苏联国立列宁图书馆 ]] 赠还原藏 [[ 日本满铁图书馆 ]] 的《永乐大典》52册。

1965年， [[ 赵万里 ]] 捐出所藏2册《永乐大典》。

1983年：中国国家图书馆从 [[ 山东 ]] 入藏1册。