产粮农业和畜牧业为地方经济的主体。农作物限于 [[ 小麦 ]] 、 [[ 大麦 ]] 、 [[ 甜荞麦 ]] 和 [[ 苦荞麦 ]] 、 [[ 玉蜀黍 ]] 、 [[ 马铃薯 ]] 及 [[ 豆类 ]] 。果木，特别是 [[ 杏 ]] 和 [[ 胡桃 ]] ，曾是当地重要食品来源。在到2134米为止的低坡，生长期足够两熟。在这样的高度，白昼温暖，夜晚凉爽，空气明净;然而，如果没有交错的灌溉设施，这一地区的干燥会使人们无法耕种。此种灌溉设施是这里所有居住区的一个特征。

谷地中以中亚植物区系占优势，而较多的欧洲植被类型则见于海拔较高处。大多数种、属分布在海拔3500~4000 ～4000 米的温带。

植物的垂直分带仅限于北坡和西坡，由谷底向上依次为 [[ 干旱半干旱草原 ]] 、 [[ 阿蒂米西亚森林草原 ]] 、 [[ 湿润温带针叶林 ]] 、 [[ 亚高山桦 ]] 属<ref>[https://www.shenghuopu.cn/article/3700.html 高山桦]，生活铺，发布时间：2018-01-23 11:05:41</ref>和 [[ 梣属灌丛 ]] 及 [[ 高山植被 ]] 。植被带的界限，向北随干燥度的不断增加而升高，致使中间森林带范围渐小而终于消失。

在较温湿的南坡，从谷地到海拔约3000米处，有 [[ 松林 ]] 、 [[ 喜马拉雅山杉 ]] 生长，邻近河流处可见柳和白杨。由此往上，为高山草原。喀喇昆仑山的动物包括 [[ 雪豹 ]] 、野生的 [[ 牦牛 ]] 和 [[ 西藏羚羊 ]] 。在南坡山麓地带有 [[ 野驴 ]] 、 [[ 短耳兔 ]] 和 [[ 土拨鼠 ]] 。鸟类有 [[ 砂松鸡 ]] 、 [[ 西藏雷鸟 ]] 、 [[ 鹧鸪 ]] 、 [[ 朱鹭 ]] 、 [[ 白鸽 ]] 及 [[ 红花鸡 ]] 等。

过去无节制的狩猎行为及商业行为，造成山中野生动物数量锐减。 [[ 马可波罗 ]][[ 绵羊 ]][[ 东帕米尔 ]] 繁殖，然后迁徙到西 [[ 喀喇昆仑山脉 ]] 。

[[ 拉达克东方盘羊 ]] 分布在东部较为平坦的高山，而 [[ 西伯利亚高地山羊 ]] 和 [[ 捻角山羊]](两者均为野山羊)盘桓於岩坡。 [[ 棕熊 ]] 、 [[ 猞猁 ]] 和 [[ 雪豹 ]] 是濒危物种。 [[ 巴基斯坦 ]] 红其拉甫(Khunjerab)国家公园与毗邻的中国 [[ 塔什库尔干自然保护区 ]] 成了高山动物的避难所。在东部边际， [[ 骞驴 ]] 和其他几种野生有蹄动物，包括少数野生牦牛，在荒凉的高原上徜徉。大型猛禽，特别是 [[ 喜马拉雅秃鹰 ]] 、 [[ 髯鹫 ]] 和 [[ 金雕 ]] ，翱翔在山风的上升气流之中。

喀喇昆仑山的冰川，与当地人民的经济活动关系至为密切。跃动冰川的快速前进，冰融水道的变迁，冰川阻塞湖的溃决及冰川泥石流暴发，都对山区农业、牧业、交通运输产生巨大影响。如 [[ 乔戈里峰 ]] 东北， [[ 叶尔羌河 ]] 曾于1961、1971与1978年分别发生过6270立方米/秒，4570立方米/秒和4700立方米/秒的特大洪水，危害下游道路、农田与水库。村落分布亦受制于冰川。谷地为旱涝保收的中亚灌溉区之一。