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上海应用物理研究所上海应物所承担中国科学院战略性先导科技专项“未来先进核裂变能——钍基熔盐堆核能系统（TMSR）”的研究和发展相关核能科学与技术，还承担“变革性洁净能源技术与示范”、上海光源线站工程（二期）、X射线自由电子激光试验装置工程、X射线自由电子激光用户装置工程、首台国产质子治疗示范装置研制项目，国家重点研发项目，基金委重大项目等国家重要科研任务。

截至2022年9月30日，中国科学院上海应用物理研究所位列自然指数年度榜单第144名。

人才培养

根据2015年12月研究所官网显示，中国科学院上海应用物理研究所是1981年国务院学位委员会批准的博士、硕士学位授予权单位之一。1989年，研究所设立物理学博士后科研流动站。2003年，设立核科学技术博士后科研流动站。研究所设有一级学科博士学位授权点2个，博士学位授权学科（专业）点5个，一级学科 硕士学位授权点3个，硕士学位授权学科（专业）点14个（其中专业学位4个）并设有2个博士后科研流动站。

教学建设

根据2015年12月研究所官网显示，中国科学院上海应用物理研究所于1964年招收物理专业研究生2人，“文革”停止招收研究生。1978年，重新恢复招收研究生，首批招收人数为4人，均为物理专业的硕士研究生。历年来共培养硕士毕业生265人，博士毕业生230人；2008年，有在读研究生345人，其中硕士生189人、博士生156人。2007年，开始招收外国留学生，招收物理专业留学生3人。截至2014年底，研究所共有在学研究生402人，其中硕士生195人、博士生207人）。

截至2008年7月底，研究所共招收博士后研究人员47名，其中2名为与企业博士后工作站联合培养。研究所博士后研究人员在站期间共申请到国家、中科院和上海市各类博士后科研工作资助21项，4人次获得“中国科学院优秀博士后”和“上海市优秀博士后”称号。

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