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回文序列遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段，该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA，存在对称中心，对称中心两侧碱基关于该对称中心对称，可形成互补。故回文序列能够形成发夹结构（茎环结构）。
回文序列广泛存在于各种生物体基因组中，主要和转录终止有关，也是限制性内切酶酶切位点，还参与DNA复制等生命活动。
中文名:回文序列
存在位置:DNA、RNA、多肽
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释义
如果一个（单链）核苷酸的序列和它的反向互补链的序列一样，那么这个核苷酸序列就是回文序列。回文序列结构不仅在DNA中存在，在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构，有利于稳定RNA的结构和行使功能 。回文序列也经常出现在组成蛋白质的肽序列中，但它们在蛋白质功能中的作用尚不清楚 [1] 。
短的回文结构可能是一种特别的信号，如限制性内切酶的识别序列。较长的回文结构容易转化成发夹结构，可能有助于DNA与特异性DNA结合蛋白结合 ；[2] 。
特征与功能
特征
有对称中心。例如，DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列，是因为它的互补序列是TGGATCCA，而反向互补序列是ACCTAGGT，和其原来序列一致。
功能
1）是限制性内切酶的识别位点；
3）转录终止时的识别结构；
4）基因工程的"手术刀"。
例子
限制性酶切位点
回文序列在分子生物学中起着重要的作用。许多限制性内切酶能识别特定的回文序列并切割它们。比如，限制性内切酶EcoR1识别以下回文序列：
5'- G A A T T C -3'
3'- C T T A A G -5'
甲基化位点
回文序列也可能有甲基化位点。这些是甲基可以附着在回文序列上的位点 [3] 。
T细胞受体中的回文核苷酸
T细胞受体（TCR）基因的多样性是通过从其生殖系编码的V、D和J段重新排列后的插入核苷酸而产生的。在V-D和D-J连接处的核苷酸插入是随机的，但其中的一些小的子集插入是例外，一到三个碱基对反向重复生殖系DNA的序列。这些短的互补的回文序列称为P核苷酸 ；[4] 。
视频
Python算法实战｜最长回文子序列
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参考文献
- ↑ [Giel-Pietraszuk, M., Hoffmann, M., Dolecka, S., Rychlewski, J., Barciszewski, J ．Palindromes in proteins. ：J. Protein Chem，2003：22 (2), 109–113]
- ↑ [Larionov, S., Loskutov, A., Ryadchenko, E ．Chromosome evolution with naked eye: palindromic context of the life origin ：Chaos，2008：18 (1), 013105]
- ↑ [Elhai, J． Highly iterated palindromic sequences (HIPs) and their relationship to DNA methyltransferases：Life，2015：5(1), 921-948]
- ↑ [Srivastava, S.K., Robins, H.S ．Palindromic nucleotide analysis in human T cell receptor rearrangements： PLOS ONE， 2012：7 (12), e52250]