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序列同源性
圖片來自优酷

同源性是序列同源或不同源的一种论断。两条蛋白质序列即使没有统计上显著的一致性,它们也可能是同源的,同源蛋白总是在三维结构上有显著的相似性,如果两条序列有一个共同的进化祖先,那么它们是同源的。

释义序列同源性:同源蛋白质的氨基酸序列具有明显的相似性

同源蛋白质的氨基酸序列具有明显的相似性,这种相似性称为序列同源性.具有序列同源性的蛋白质称为同源蛋白质,同源蛋白共有的相似序列称为共义序列.

(一)同源蛋白质的物种差异与生物进化

同源蛋白质、细胞色素c系统树

(二)同源蛋白质具有共同的进化起源

氧合血红素蛋白质、丝氨酸蛋白酶类

序列的相似性与同源性有什么区别与联系

一、区别

1、概念不同

同源性(homology):进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系,同源性是来描述物种之间的进化关系的,所以在同源性的表达中只能用“有”或者“无”,对于有同源性的物种可以描述为“部分同源”或者“完全同源”。

相似性(similarity):是指所检测的序列与目标序列之间相同的碱基或氨基酸占整个序列的比例(相对宏观的一个描述)。在氨基酸序列比对中相似性还包括,除了完全相同的残基外,在对应位置的两个残基是否具有相似的特性,如侧链基团的大小、电荷性亲疏水性等。

比如在氨基酸序列的比对中(以vector NTI为例),完全相同的氨基酸都会被标为黄色,特性相似的氨基酸会被标为绿色。

2、表达方式不同

同源性的表达中只能用“有同源性”或者“无同源性”,对于有同源性的物种可以描述为“部分同源”或者“完全同源”。

相似性可以表达为“两条序列具有80%的相似性”,表示所检测的序列与目标序列之间相同的碱基或氨基酸占整个序列的比例为80%。

二、联系

相似性与同源性的氨基酸或核苷酸序列通常有显著的一致性(identity),如果两条序列有一个共同的进化祖先,那么它们是同源的。这里不存在同源性(homology)的程度问题,两条序列要么是同源的要么是不同源的。

同源性(homology)这个概念不能量化,“两条序列具有同源性”或者“不具有同源性”。而相似性(similarity)和一致性(identity)可以看作是从不同的角度对同源性的量化指标。

一般地,两条序列之间的相似性(similarity)的程度会大于一致性(identity)的程度。一般来说,序列之间的相似性(similarity)和一致性(identity)越高,序列之间同源的可能性越大。

扩展资料:

同源性的特性:

同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源,最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说,如果两个物种中有两个性状(状态)满足以下两个条件中的任意一个,就可以称这两个性状为一对同源性状:

1、它们与这些物种的祖先类群中所发现的某个性状相同;

2、它们是具有祖先—后裔关系的不同性状。

由于进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性,但其功能不一定相同,如狗的前肢和鸟的翅。从分子水平讲则是指两个核酸分子核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。

虽然同源性须通过序列测定来检验,但是DNA-DNA或DNA-RNA杂交可提供有价值的估计。

视频

序列比对的重要概念——同源、一致和相似

[1]

参考文献