萱草常见的病害有叶斑病、叶枯病、锈病、炭疽病和茎枯病等：虫害主要有红蜘蛛、蚜虫、蓟马、潜叶蝇等。<br>

防治病虫害：首先要搞好农业防治，在萱草采摘完后，地上部随即枯死，应及时割蔸并运离萱草地外，以减少菌源、虫源；搞好萱草的追肥、冬培工作，以增强抗病能力；适时更新复壮老蔸；选用抗病品种等。适时用药防治，病害可用75%的百菌清800倍液喷雾防治，虫害可用艾美乐3000倍喷雾防治。<br>

萱草不等于[[黄花菜]]。[[黄花菜]]是萱草属植物的一种，但除黄花菜外的萱草属植物多半不可食用。我们日常种植玩赏的萱草花不是[[黄花菜]]，而是[[大花萱草]]、[[卷丹]]之类；[[黄花菜]]一般出现在菜地里，而非花坛中。切勿从花坛中采“萱草”来吃，以免中毒。<br>

[[黄花菜]]花朵比较瘦长，花瓣较窄，花色嫩黄。观赏用萱草的花则接近一些漏斗状百合，花色一般呈橘黄色，有的甚至接近红色。<br>