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行一特定的機能。 以下是已知蛋白質的機能： 酵素，作為代謝反應的催化劑。結構蛋白質，像微管蛋白或膠原蛋白。調節蛋白質，轉錄因子或是調節細胞週期的週期素。作為信息分子或信息分子的受體，像某些激素及其受體。防禦蛋白質，包括免疫系統中的抗體，或是毒素（例如曼巴蛇素dendrotoxin），或是包括像刀豆