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他初渡海到普陀山，遍参各寺刹；继到 [[ 宁波 ]] 阿育王寺拜佛舍利，到 [[ 杭州 ]] 礼天朗和尚，到天宁寺礼清光和尚，到焦山礼大水和尚，到金山亲近观心、新林、大定等和尚，到扬州高旻寺礼朗辉和尚，他到焦山时，清廷名将 [[ 彭玉麟 ]] 督水师驻焦山，曾数度约他谈论佛法及修行途径，对他深生敬信。到了光绪八年（1882年），他二度朝礼普陀，为报亲恩，再礼五台。是年七月一日，自普陀法华庵起香，三步一拜，一直拜到五台山。初开始时，有偏真、秋凝等四僧附香，渡海由宁波登陆，向北前进，过了苏州、常州，天候渐冷，四位附香者先后退出。他一个人礼拜前进，经 [[ 南京 ]] 渡江到浦口，在狮子山寺挂单过年。过了春节，再由狮子山寺起香，经苏北入河南，经嵩山少林寺、洛阳白马寺，到了腊月，拜到 [[ 黄河 ]] 边的铁谢渡。渡过黄河，错过宿店，在路边一个茅棚中度夜。后半夜大雪纷飞，黎明后积雪盈尺，过往无人，他在茅棚中枯坐念佛，饥寒交迫，日复一日，到了第六日终至陷入昏迷状态。后来得一姓“文”名“吉”之丐者相救，得继续前进，拜到豫北怀庆府，在洪福寺挂单过年。正月初二再起香前进，拜到五月底终于拜到五台山的显通寺。自光绪八年七月由普陀山起香，到十年五月到显通寺，途中足足跪拜了二十三个月，这种毅力，实不是常人所能及！

这年下半年，他礼拜北岳恒山、西岳华山。翌年春抵西安，礼慈恩寺大雁塔、华严寺杜顺和尚塔、清凉国师塔，及兴教寺玄奘法师塔。然后入终南山，在南五台结茅修行。这时在南五台结茅的，还有觉朗、冶开、法忍、体安、法性诸师，虚云与诸师同参究，他自觉甚有饶益。在终南结茅两年余，他下山后，在 [[ 西安 ]] 附近，礼道宣祖师塔，礼 [[ 鸠摩罗什 ]] 道场，然后越秦岭，入子午谷，经汉中，入剑门到了 [[ 四川 ]] 。第二年到 [[ 成都 ]] ，上峨眉山金顶进香。然后渡泸水，经打箭炉入 [[ 西藏 ]] 。到了 [[ 拉萨 ]] ，礼布达拉宫（达赖活佛坐床之所）；也到了札什伦布，礼札什伦布寺（ [[ 班禅 ]] 活佛坐床之所），他这一年登山涉水，遍游川藏，岁暮在拉萨过年。

光绪十五年（1889年），这一年他年已五十岁。因不愿在西藏久留，开春南行，经不丹国，翻越重山峻岭（事实上就是 [[ 喜马拉雅山 ]] ），到了 [[ 印度 ]] 。朝礼圣迹后，又渡海到锡兰，然后又到了 [[ 缅甸 ]] 。这样兜了个大圈子，是年七月启程回国，由腊戌过汉龙关。入 [[ 云南 ]] 境，到了大理。他回国的初愿是朝鸡足山，礼迦叶尊者道场。七月底，他到了鸡足山，进香礼拜。又登山顶天柱峰，礼楞严塔。鸡足山全盛时，有三百六十庵、七十二大寺。而虚云和尚到时，全山不足十寺，都是子孙庙，不许外地僧侣挂单。他叹息不已，下山而去。

以后两年，他仍在各地参访。到衡阳岐山寺礼恒志和尚，到 [[ 武昌 ]] 宝通寺礼志摩和尚，学“大悲忏”法，到庐山海会寺礼志善和尚，到九华山礼宝悟和尚，到宝华山礼体性和尚；以及到宜兴礼仁智和尚，到句容礼法忍和尚。光绪十七年（1891年），在南京净成寺，与杨仁山居士往来，讨论《因明论》、《般若灯论》。以后又到九华山结茅修行。这样到了光绪二十一年（1895年），扬州高旻寺住持月朗约他到扬州做法事，他渡江时失足堕水，甘自一昼夜，为渔者所救，把他送到宝积寺，醒过来时，七孔流血不止。后来到了高旻寺，月郎分派他职事，他不接受，只求在堂中打七，月朗以为他“慢众”，当堂打香板，他顺受不语。后来宝积寺僧到了高旻，说出他堕水获救那一段事，才免去禅堂职事，他得便专心修行。