1953年，以78高齡，應[[董必武]]之邀任中國科學院近現代史研究所研究員，以親身經歷著述回憶辛亥革命、北洋軍閥時期的往事，寫成《北洋軍閥的起源》《孫中山與袁世凱的鬥爭》《洪憲遺聞》 《黎元洪與段祺瑞的鬥爭》等數十萬字，留下了珍貴的歷史資料。1955年，當選第二屆全國政協委員。1959年1月25日，張國淦在 [[ 北京 ]] 病逝。享年84嵗（満82歳）。<ref>[https://k.sina.com.cn/article_6036064462_167c708ce00100j5is.html?from=history 北洋政客大多紙醉金迷，唯有袁世凱秘書長張國淦潛心學術著作等身]</ref>