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进入CBA后，云南在首个赛季打出惊人的22胜16负的成绩排在了积分榜的第四位，令人赞叹。这一年球队的主教练是吴庆龙，主要队员有遇俊锴、贾楠等长期在CBA征战的老将，还有像联赛“得分王"李-本森这样的实力外援，遇俊锴更是获得了当年联赛的"三分王”称号。第二年他们再次杀入八强，但进入2006年，球队面临大动荡，最终仅仅取得2胜，球队从此一落千丈。2009年，球队[[董事长]]韩志昆因[[经济问题]]已被红河州反贪局拘捕，红河在资金上出现问题，并闹出了欠薪丑闻，被球员和教练告上了法庭。最终，篮协通过决定，取消了云南队的参赛资格<ref>[http://www.chinalushan.com/info/info_2551.htm 清凉庐山：不到三叠泉不算庐山客]，中国庐山旅游网，2013-8-23 </ref><ref>[https://xw.qq.com/cmsid/20181007A0XNRI00 云南红河男篮：建队一年便进入CBA老板被抓球队仅5年就宣布解散]，腾讯网，2018-10-07 </ref>。