埃及航空是由政府出资拥有，是中东及阿拉伯国家的最佳航空公司之一，经营定期航班服务包括飞往欧洲、非洲、中东、远东、美国及埃及国内的航线，飞往40多个国家的近70个目的地。
埃及航空成立于1932年6月7日，并于1933年7月开始营运。当时联同 Airwork Company 共同成立 Misr Airwork。第二次世界大战期间，埃及政府接管航空公司并于1949年改名为 Misr Air。1961年一月，因埃及及叙利亚建立新的政治联系，Misr Air 与叙利亚航空公司(Syrian Airways)共同成立阿拉伯联合航空公司(United Arab Airlines (UAA))，但这协议只维持了短暂时间。此名称维持了一段时间，直至1971年20月才更改为埃及航空(EgyptAir)。
埃及航空为中东地区首间经营喷射客机的航空公司。航空公司共聘请约22,000员工，于2000财政年度，埃及航空的全球总收入达10亿美元，利润达3,500万美元。航空公司曾于2002年进行重组，进一步提升公司效率。
埃及航空全资拥有西奈航空(Air Sinai)及拥有开罗航空60%股份。
埃及航空将于2007年4月开办区域航线支部。新成立的子公司名为 EgyptAir Express，于2007年首季拥有6架巴西航空工业(Embraer) 生产的Embraer 170，航空公司亦有另外6架的选择购买权。
2019年11月29日，埃及航空开通杭州直飞开罗航线。杭州直飞埃及开罗航线正式开通，该航线由埃及航空787-9梦想客机执飞，每周运营两班，飞行时间约11小时。