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土壤中含有多种酶，有的酶是土壤生物分泌的，有的酶则是[[细胞]]死后释放出来的。土壤中的酶在催化土壤中多种生化反应、保持土壤的生物学平衡 <ref>[http://www.docin.com/p-1444039973.html 精品土壤生物学]，豆丁网</ref> ，以及净化土壤等方面，都有重要意义。

土壤中的生物数量大、种类多，包括多种微生物、植物和[[动物]]，其中最多的是微生物，如细菌、放线菌、真菌和[[蓝藻]]等 <ref>[http://news.zxxk.com/article/354112.html 土壤微生物]，学科网，2014-07-10</ref> ，每公顷肥沃土壤表层有几吨到几十吨的微生物。它们生理习性各不相同，在不同的环境条件下，分别起着不同的作用(见土壤微生物学。土壤中的植物主要是一些小型藻类、各种植物的根系以及枯枝落叶等。土壤动物小的要用显微镜才能看到，如原生动物、轮虫、小线虫等;大的肉眼就可看到，如蜗牛和蛞蝓、蜈蚣和马松、各种较大的昆虫和蚯蚓以及多种啮齿目(鼠类)和食虫目(鼹鼠)哺乳动物等;介乎二者之间的如各种小蜘蛛、螨类和小型昆虫等。它们以微生物、别的土壤动物或植物为食，或以土壤中的有机质为食;有的一生都在土壤中度过，有的仅在其生活史中的一段时间在土壤中度过;有的营穴居生活，在土壤中挖掘通道、打洞作窝;有的则生活于现成的土壤孔隙之中或生长于土表废渣之下。土壤动物的种类很多，数量也很大，每公顷土壤表层有几百千克到几吨。