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汉莎货运航空的枢纽机场法兰克福机场是[[欧洲]]最大的货运机场 <ref>[http://www.cannews.com.cn/2013/0423/15760.shtml 欧洲最大的航空货运中心：法兰克福机场]，中国航空新闻网，2013-04-23</ref> 。在这里，机场管理机构Fraport AG与汉莎货运航空的合作紧密。汉莎货运航空是机场北部货运城的主要用户，并且逐渐开始向南部货运城扩张。之所以对南部货运城感兴趣，是因为绝大多数的[[国际]]性[[货物]]承运商、空货承运商的主要客户都已在此落户，并可提供可靠便捷的陆运及海运网络。[[机场]]与汉莎货运航空就夜间禁飞令有着明显的意见分歧。机场正计划扩大容量及运量，对减少其对所有航班禁止夜间飞行所造成的影响。相比之下，汉莎货运航空则期望建立“切实可行的夜间飞行安排”。

汉莎货运航空是全球首家航空货运战略联盟WOW航空联盟 <ref>[https://www.ufsoo.com/news/detail-225208d0-a3af-4ae9-8988-9f86bdb1ae9c.html WOW货运联盟（WOW Cargo Alliance）-航空联盟介绍（五）]，通用运费网， 2020-3-17 </ref> 的创始成员。该联盟的成员还包括北欧货运航空、[[新加坡货运航空]]和[[日本货物航空]]。与[[星空联盟]]类似，汉莎货运航空在2008年中期也将其一架编号为D-ALCE的麦道MD-11货机漆上WOW联盟涂装，以在全球范围内宣传该货运联盟。所有其它[[飞机]]也将涂上不同[[颜色]]的标签，表明其与WOW联盟的成员资格。到2007年底，汉莎货运航空已在其所有[[商业]]文件上（包括信笺、名片等）都将使用联盟的标识。而在2008年[[春季]]，汉莎货运航空总裁卡斯滕·斯泼尔表示，航空货运联盟由于自己密集的航线网络而显得有些多余。2009年公司退出WOW货运联盟。