1907年6月，中英雙方談判關於藏印通商章程事宜。談判前，英方堅持要有權簽字的西藏官員參加會議。儘管張蔭棠認為其「志與藏人直接，不欲我國干預」，「若一經承認直接交涉，西藏即成獨立國性質」<ref>《张荫棠奏牍》，卷三，第1、50页。</ref>，但勢弱之下只便增派西藏噶倫汪曲結布，攜帶[[噶廈]]議事簽字全權文憑赴會。谈判中，張蔭棠对有损中国主权的内容坚决反对，如提出中、英、藏三方不能并列；各商埠治理权应归中国官吏督饬藏官员管理，中英商务纠纷应各禀请驻藏大臣及[[印度总督]]处理等。经过反复争议，中英双方都有所让步。在有关西藏代表的资格问题上，规定“西藏大吏选派噶布伦汪曲结布为掌权之员”，但他需“禀承张大臣训示，随同商议”；有关各商埠治理权的归属，基本上维持了“应归中国官督饬藏官管理”这一原则。1908年4月20日，《中英修訂藏印通商章程》正式签订，共十五款。根据此章程，英国在西藏有治外法权、会审权，允许英人“在各商埠内租地建筑货栈”等。但在承认1893年（光绪十九年）所订《[[中英藏印續約]]》的原则下，中国收回了对西藏的某些治权。