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2015年6月1日子公司中国北车股份有限公司和中国南车集团公司旗下的中国南车股份有限公司合并成立新的[[中国中车股份有限公司]] <ref>[http://m.haiwainet.cn/middle/455817/2015/0602/content_28794790_1.html 中国南车与北车合并 6月1日起更名为中国中车]，人民日报海外网，2015-6-2</ref> ，中国北方机车车辆工业集团公司是新公司的第二大[[股东]]。

1990年代末开始，随着中国政府对铁路、民航、电信、烟草、军工等国营产业系统脱钩工作的部署。为改变财产边界不清、生产效率低下的状况，中国铁道部进行了打破政企合一、[[行业]][[垄断]]的铁路运输行业体制的改革研究，于1998年底开始了对直属企业改组、调整、清理、规范的工作。铁道部首先决定了中国铁路工程总公司、中国铁道建筑总公司、中国铁路机车车辆工业总公司、[[中国铁路通信信号集团公司|中国铁路通信信号总公司]]、中国土木工程集团公司等五大直属非运输企业作为首批脱钩单位，脱钩方式采用总公司（集团）整体移交中央政府管理的方式进行。2000年3月23日，铁道部、国家经贸委联合向[[国务院]]上报了《关于铁路非运输企业政企分开方案的请示》。同年4月24日，方案得到国务院批复通过，5月进入五大公司（集团）脱钩移交阶段。2000年9月，经中华人民共和国国务院批准，根据构建竞争主体、避免重复建设的精神，中车公司分拆为中国北方机车车辆工业集团公司和中国南方机车车辆工业集团公司两家国有独资大型集团公司 <ref>[https://www.chuandong.com/news/news149791.html 进击的中国高铁：南北车合并的“前世今生”]，中国传动网，2014-12-03</ref> ，从铁道部归口管理划归为[[国务院国资委]]管理。2000年9月28日，铁道部印发《关于向中央工委移交中国铁路工程总公司等企业领导班子管理职责的通知》，依法规范了铁道部、铁路企业与五大公司间的相互关系，标志着铁道部与五大公司正式实现政企分开。