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Β-半乳糖苷酶

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'''β-半乳糖苷酶'''(英語:β-galactosidase, β-gal或β-gal )也稱為乳糖酶 ,是一種 [[ 水解 ]] 酶,催化β-半乳糖苷水解成單糖。使β-半乳糖苷酶作用的底物包括神經節苷脂GM1、乳糖苷、 [[ 乳糖 ]] 、各種糖蛋白。它可通過破壞糖苷鍵化將β-半乳糖苷水解為 [[ 單醣 ]] 。包括含有半乳糖的碳水化合物,其中糖苷鍵位於半乳糖分子上方。不同的β-半乳糖苷酶的底物包括神經節苷脂GM1,乳糖基神經酰胺,乳糖和各種糖蛋白。
==屬性與功能==
===人體必需的酶===
'''β-半乳糖苷酶'''是人體必需的酶,它是一種外糖苷酶 ,專門水解在半乳糖和其有機部分之間的β- 糖苷鍵。它也可以裂解岩藻糖苷和阿拉伯糖苷,但效率低得多。蛋白質缺乏會導致半乳糖[[唾液]]酸中毒或Morquio B綜合症。在大腸桿菌中,lacZ基因是β-半乳糖苷酶的結構基因。它是可誘導系統lac操縱子的一部分,當葡萄糖水平低時,該操縱子在乳糖存在下被激活。 當 [[ 葡萄糖 ]] 水平足夠時,β-半乳糖苷酶的合成停止。
β-半乳糖苷酶具有基於相似序列的許多同源物。少數是進化的β-半乳糖苷酶(EBG),β-葡萄糖苷酶 ,6-磷酸-β-半乳糖苷酶,β-甘露糖苷酶和乳糖酶-蘆硫苷水解酶。 儘管它們在結構上可能相似,但是它們都有不同的功能。[“糖苷水解酶,家庭1,β-葡萄糖苷酶(IPR017736)<InterPro <EMBL-EBI”。www.ebi.ac.uk3]β-gal被L-核糖,非競爭性抑製劑 碘和競爭性抑製劑苯硫基-β-D-半乳糖苷(PETG),D-半乳糖內酯, 異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)抑制 ,和半乳糖。
===產生能量的關鍵提供者===
β-半乳糖苷酶對生物很重要,因為它是產生能量的關鍵提供者,並且通過乳糖分解為半乳糖和葡萄糖而成為碳的來源。 這對於乳糖不耐症社區也很重要,因為它負責生產無乳糖的 [[ 牛奶 ]] 和其他乳製品。 許多成年人缺乏乳糖酶,該酶具有相同的β-gal功能,因此他們無法正確消化乳製品。 β-半乳糖用於酸奶,酸奶油和一些奶酪等乳製品中,經過酶處理後可以分解任何乳糖,然後再食用。 近年來,已經通過基因替代療法研究了β-半乳糖苷酶作為 [[ 乳糖不耐症 ]] 的潛在治療方法,可以將其放入人類DNA中,以便個人可以自行分解乳糖。
β-半乳糖苷酶,它也可能裂解岩藻糖和阿拉伯糖所形成的糖苷,但是效率比較低。 它是人體中所必需的酶。在此 [[ 蛋白質 ]] 不足的情況下可能導致Galactosialidosis(為一種溶酶體儲積病)或莫爾基奧乙綜合徵。在大腸桿菌中的β-半乳糖苷酶的 [[ 基因]]--lacZ的基因為誘導型系統的一部分,乳糖操縱子是於低血糖時在乳糖的存在下被激活。
===監測基因表達的指標印記===
分子生物學中經常使用β-半乳糖苷酶作為監測基因表達的指標印記。β-半乳糖苷酶也表現出藍/白篩選重組複製中稱之為α-互補形成的現象。這種酶可以分開為二種胜肽,分別為LacZ基因α和LacZΩ,這兩者自身分別都不是反應端,但是當兩者同時存在時,會自發地重新組合成一個有功能的酶。這個特性被利用在許多複製載體(克隆),其中在有lacZα基因的質體表現可以將實驗室的大腸桿菌病株中的LacZΩ基因轉換為另一個突變基因。然而,當DNA片段插入到載體中,製作LacZα的被打亂,因此細胞沒有表現β-半乳糖苷酶的活性。β-半乳糖苷酶活性表現的存在與否可透過X-gal的檢測來判斷,如果質體沒有插入此外來基因,就能成功表現出β-半乳糖苷酶的活性,就能成功分解X-gal,使菌落成為藍色。反之,插入外來基因的質體無法分解X-gal(因為β-半乳糖苷酶無法表現),而成為白色的菌落。
1995年,由Dimri等人。提出了β-半乳糖苷酶具有在PH 6.0 的新亞型(衰退與β-半乳糖苷酶和SA-β-半乳糖苷酶(衰老)有關)這被拿來特別表達老化(細胞的不可逆的生長停滯)。具體的定量測定法甚至開發了他的感應檢測。 然而現在已經知道,這是溶酶體內源β-半乳糖苷酶的積累,而使其過度表現不需要的衰老。儘管如此,它仍然是最廣泛使用在衰老以及衰好 [[ 細胞 ]] 的生物標記物,因為它具有相當可靠的和容易檢測之特性。
==結構==
β-半乳糖苷酶的活性端通過「淺層」與「深層」結合基質來催化水解雙糖。一價的鉀離子(K+),以及二價的鎂離子(鎂2+)需要酶的最佳活性。以β-核苷間鍵為基質經由穀氨酸側鏈上的羧基終端裂解而成。 在大腸桿菌中,穀氨酸-461被認為是取代反應的親核試劑。然而,現在已經知道穀氨酸-461是一種酸[催化劑]。相反的,穀氨酸-537為實際的親核試劑,他是結合到半乳糖的中間體。
在人類中,是由Glu-268扮演 [[ 水解 ]] 反應的親合試劑。
==應用==
β-半乳糖苷酶檢測常用於遺傳學、分子生物學,以及其他生命科學。可用於藍/白篩檢測中,有活性的酶可以用X-gal來進行檢測,會在裂解β-半乳糖苷後形成一個深藍色的產物5-溴-4-淀藍,並且容易辨識和量化。[10] 它的生產可以透過非水解性誘導結構異構物中的異乳糖─IPTG,從lac操作者中結合並釋放lac操縱子,從而使轉錄起始端繼續進行。
因為他的高表現性質以及它在衰老細胞中的溶酶體累積的特性。儘管有其局限性,它可被當作一個老化的標誌物,藉由進行體內和體外在定性和定量可用以測定老化程度。
==反應==
β-半乳糖苷酶可以催化生物體中的兩種不同反應。 在一個過程中,它可以經歷一個稱為反式半乳糖基化反應的過程,以製造半乳糖 ,從而為β-gal的產生創造一個正反饋迴路 。 它還可以將乳糖水解為半乳糖和葡萄糖,然後進行糖酵解。β-半乳糖苷酶的活性位點通過“淺”(非生產位點)和“深度”(生產位點)結合催化其二糖底物的水解。 當酶處於“開放”構象時, 半乳糖苷(例如PETG和IPTG)將結合在淺位點,而當“閉合”構象時,過渡態類似物(例如L-核糖和D-半內酯內酯)將結合在深位點。酶促反應包括兩個化學步驟,半乳糖基化(k2 )和半乳糖基化(k3)。半乳糖基化是反應中的第一個化學步驟,其中Glu461將質子提供給糖苷氧,導致半乳糖與Glu537共價鍵合。 在第二個步驟中,半乳糖基化,當Glu461接受質子時,共價鍵斷裂,用 [[ ]] 代替半乳糖。 在每個步驟之後,在反應過程中,酶的深位會出現兩個過渡態。當水參與反應時,形成半乳糖,否則,當D-葡萄糖在第二步驟中充當受體時,發生轉半乳糖基化。動力學測定該蛋白質的單個四聚體以每分鐘38,500±900個反應的速率催化反應。單價鉀離子 (K+)和二價鎂離子(Mg 2+ )是該酶最佳活性所必需的。底物的β鍵被谷氨酸 側鏈上的末端羧基裂解。
在大腸桿菌中 ,Glu-461被認為是取代反應中的親核試劑 。然而,現在已知Glu-461是酸催化劑。 相反,Glu-537是實際的親核試劑,與半乳糖基中間體結合。在人類中,水解反應的親核試劑是Glu-268。Gly794對β-gal活性很重要。 它負責將酶置於“封閉”,配體結合,構象或“開放”構象,對活性位點環起“鉸鏈”的作用。 不同的構象確保僅優先結合發生在活性位點。在慢的底物存在下,Gly794活性增加以及半乳糖基化的增加和半乳糖基化的減少。
==使用==
β-半乳糖苷酶測定法經常用於遺傳學 , 分子生物學和其他生命科學中 。可以使用人工顯色底物5-溴-4-氯-3-吲哚基-β-d-吡喃半乳糖苷X-gal來檢測活性酶。 β-半乳糖苷酶將切割X-gal中的糖苷鍵並形成半乳糖和5-溴-4-氯-3-羥基吲哚,後者會二聚並氧化為5,5'-dibromo-4,4'-dichloro-indigo,易於識別和量化的藍色產品。 [15] 例如用於藍白色屏幕 。它的產生可能是由半乳糖的非水解類似物 IPTG誘導的,該類似物與lac操縱子結合併釋放lac阻遏物,從而使轉錄的啟動得以進行。
它在分子生物學中通常用作報告基因標記,以監測基因表達。 它還表現出稱為α-互補的現象,該現象構成了重組克隆藍/白篩選的基礎。 該酶可以分為兩個肽,LacZα和LacZΩ,它們都不具有活性,但是當兩者同時存在時,會自發重組為功能性酶。 在許多克隆載體中利用了這種特性,在質粒中lacZα基因的存在可以反演在大腸桿菌特定實驗室菌株中反編碼LacZΩ的另一個突變基因。 然而,當將DNA片段插入載體中時,LacZα的產生被破壞,因此細胞沒有顯示出β-半乳糖苷酶活性。 可以通過X-gal檢測活性β-半乳糖苷酶的存在與否,當被β-半乳糖苷酶切割時會產生特徵性的藍色染料,從而提供了一種簡便的方法來區分質粒中 [[克隆分子| 克隆 ]] 產物的存在與否。 在對 [[ 白血病 ]][[ 染色體 ]] 易位的研究中,Dobson及其同事在小鼠中使用了LacZ融合蛋白, [17] 利用β-半乳糖苷酶的寡聚趨勢,暗示寡聚性在MLL融合蛋白功能中的潛在作用。
1995年,Dimri等人。 有人提出了一種新的β-半乳糖苷酶同工型,在pH 6.0下具有最佳活性(衰老相關的β-gal或SA-β-gal ),將在衰老中特異性表達(細胞的不可逆生長停滯) <ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC40985/ 一種生物標記物,可在培養物中和體內衰老的皮膚中識別衰老的人類細胞]程序Natl/美國科學學院</ref>。甚至開發了專門的定量檢測方法進行檢測。但是,現在知道這是由於溶酶體內源性β-半乳糖苷酶的過表達和積累引起的, [23] 衰老不需要其表達。 然而,由於它可靠且易於檢測,因此它仍然是衰老和衰老細胞中使用最廣泛的生物標記。
===進化的β-半乳糖苷酶===
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